58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2322 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  100 
 
 
347 aa  716    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  79.25 
 
 
347 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  72 
 
 
354 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  71.14 
 
 
354 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  55.65 
 
 
341 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  53.12 
 
 
364 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 
352 aa  328  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  50.15 
 
 
352 aa  328  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  50.15 
 
 
352 aa  328  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  50.15 
 
 
352 aa  328  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  50.15 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  49.85 
 
 
352 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.72 
 
 
343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  50.15 
 
 
352 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  52.04 
 
 
343 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.72 
 
 
343 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.41 
 
 
343 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  51.72 
 
 
343 aa  321  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  48.31 
 
 
357 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  45.81 
 
 
356 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.92 
 
 
358 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.92 
 
 
358 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.92 
 
 
358 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.92 
 
 
358 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  48.92 
 
 
358 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  37.8 
 
 
345 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  36.8 
 
 
359 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  41.58 
 
 
347 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  37.2 
 
 
348 aa  209  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  40 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  39.66 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  37.07 
 
 
338 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  36.09 
 
 
342 aa  189  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  43.46 
 
 
688 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  41.09 
 
 
262 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3756  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.33 
 
 
163 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1210  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.33 
 
 
163 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4030  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.33 
 
 
163 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0157676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0190  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.49 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2632  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000126896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3671  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0440326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3841  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3976  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2069  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  30.91 
 
 
167 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3943  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4041  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000581015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3688  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.756476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4139  phosphopantetheine adenylyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0668  phosphopantetheine adenylyltransferase  35.94 
 
 
160 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.07 
 
 
151 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.53 
 
 
148 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1719  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  30.38 
 
 
162 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.33 
 
 
159 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0140729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  37.31 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  31.52 
 
 
435 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
152 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>