37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3862 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  100 
 
 		 333 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  95.5 
 
 		 333 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  55.02 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  37.96 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  40 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  34.29 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  39.66 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  40.55 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  38.66 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  36.99 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  39.41 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  39.74 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  39.41 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  34.44 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  37.71 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  39.41 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  39.41 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  34.27 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  34.27 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  34.27 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  34.27 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  34.27 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  34.27 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  34.27 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  33.86 
 
 		 352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  37.37 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  35.44 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  35.31 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.23 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.23 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.23 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.23 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  33.23 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  44.02 
 
 		 688 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  35.6 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  37.5 
 
 		 262 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2069  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  37.5 
 
 		 167 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>