36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0439 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0439  cytidyltransferase-related domain protein  100 
 
 
688 aa  1413    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973944 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1162  citrate lyase ligase  43.13 
 
 
345 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.161985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3862  citrate lyase ligase  44.02 
 
 
333 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0323  citrate (pro-3S)-lyase ligase  43.2 
 
 
356 aa  170  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04660  (Citrate (pro-3S)-lyase) ligase  44.5 
 
 
359 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3375  citrate lyase ligase  45.11 
 
 
341 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1673  citrate lyase ligase  32.57 
 
 
347 aa  168  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3947  citrate lyase ligase  43.48 
 
 
333 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190715 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05301  citrate lyase ligase  43.14 
 
 
262 aa  163  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1752  citrate lyase ligase  42.18 
 
 
354 aa  161  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  44.5 
 
 
343 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0063  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  45.03 
 
 
343 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  0.752435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0065  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  43.98 
 
 
343 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0062  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  44.5 
 
 
343 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.93415  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0064  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  44.5 
 
 
343 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2322  citrate lyase ligase  43.46 
 
 
347 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2025  citrate lyase ligase  44.27 
 
 
354 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0532  citrate lyase synthetase  44.74 
 
 
352 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3007  citrate lyase ligase  44.21 
 
 
352 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.52417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0669  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  44.21 
 
 
352 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.850231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0637  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  44.21 
 
 
352 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3026  citrate lyase ligase  44.21 
 
 
352 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00586  citrate lyase synthetase  44.21 
 
 
352 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00575  hypothetical protein  44.21 
 
 
352 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0706  citrate lyase synthetase  43.68 
 
 
352 aa  154  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3171  citrate lyase ligase  43.92 
 
 
357 aa  154  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16085  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2220  citrate lyase ligase  41.8 
 
 
347 aa  154  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0724  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  42.33 
 
 
358 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0664  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  42.33 
 
 
358 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0737  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  42.33 
 
 
358 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0678  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  42.33 
 
 
358 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0783  [citrate (pro-3S)-lyase] ligase  42.33 
 
 
358 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.46183  normal  0.28967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  38.89 
 
 
338 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2410  citrate lyase ligase  41.49 
 
 
364 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0420  citrate lyase synthetase  38.65 
 
 
348 aa  144  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1522  citrate lyase ligase  41.08 
 
 
342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>