22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0885 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.956443  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  47.19 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  40.45 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  35.56 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1143  hypothetical protein  32.24 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0762  hypothetical protein  25.27 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.036858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00260  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshD (pilus type IV)  25.37 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4567  MSHA pilin protein MshD  22.73 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.490288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3266  MshA pilin protein MshD  29.94 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  26.85 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03689  hypothetical protein  32.79 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  28.93 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0179  prepilin-type cleavage/methylation-like  23.12 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0554  methylation site containing protein  27.12 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.406745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3826  MSHA pilin protein MshD  23.39 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3103  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4103  MSHA pilin protein MshD  24.24 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  24.56 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3652  methylation site containing protein  24.42 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0475  methylation site containing protein  25 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0639844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4406  methylation site containing protein  35.09 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.73799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5688  hypothetical protein  29.08 
 
 		 181 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.960278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>