40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5691 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  100 
 
 		 107 aa  212  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  69.16 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  67.29 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  65.42 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  64.49 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  67.29 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  63.55 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  65.42 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  57.41 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  47.22 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  52.78 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  37.14 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  36.54 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  41.76 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  38.27 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  36.96 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  37.04 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  37.21 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  39.44 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  39.44 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  39.44 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  40.79 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  42.37 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  42.37 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  39.06 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  38.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  38.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  38.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  38.16 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  38.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  38.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  38.16 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  29.07 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  29.07 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  26.67 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>