82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3942 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  96.38 
 
 		 138 aa  245  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  85.48 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  74.8 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  73.17 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  75.21 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  75.21 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  75.21 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  74.38 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  73.55 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  73.55 
 
 		 134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  73.55 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  72.73 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  72.73 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  72.73 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  70.08 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  72.73 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  73.5 
 
 		 117 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  49.6 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  46.67 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  50 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  52.59 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  50 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  49.15 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  44.92 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  44.74 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  41.53 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  47.86 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  41.18 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  47.52 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  37.8 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  41.07 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  43.56 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  44.14 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  36.54 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  41.82 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  42.22 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  41.11 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35.59 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  36.84 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  50 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  50.52 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  34.65 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  29.59 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  27.12 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  26.67 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  40.28 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  40.28 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  36.04 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  37.11 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  26.05 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  29.31 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  27.5 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  27.55 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  28.95 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  27.19 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  27.27 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  27.55 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  27.55 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  27.55 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  26.53 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  29 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  26.8 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  32.65 
 
 		 159 aa  47.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  27.82 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  40.28 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  50.98 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  30.63 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  37.1 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  41.07 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1135  Tfp pilus assembly protein  34.07 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  40.35 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  38.81 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  46.94 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  37.1 
 
 		 125 aa  40  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>