More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3693 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1811  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  88.66 
 
 
388 aa  714    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2602  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  87.11 
 
 
388 aa  691    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586554  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  88.4 
 
 
388 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal  0.124271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3693  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
388 aa  797    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.625354  normal  0.0697869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3255  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  83.55 
 
 
384 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3538  butyryl-CoA dehydrogenase  79.12 
 
 
386 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689512  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0658  acyl-CoA dehydrogenase  68.56 
 
 
388 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1669  butyryl-CoA dehydrogenase  70.54 
 
 
385 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.260436  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  71.24 
 
 
397 aa  564  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01704  acyl-CoA dehydrogenase family member 8  71.77 
 
 
393 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791292  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1377  butyryl-CoA dehydrogenase  69.25 
 
 
385 aa  564  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0267981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1941  butyryl-CoA dehydrogenase  70.5 
 
 
385 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2769  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.73 
 
 
385 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.329604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1679  acyl-CoA dehydrogenase family protein  68.48 
 
 
385 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1340  butyryl-CoA dehydrogenase  68.99 
 
 
385 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.92296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1399  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.48 
 
 
385 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1527  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.22 
 
 
385 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2595  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.48 
 
 
385 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.22 
 
 
385 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.553599  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1491  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.22 
 
 
385 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.22 
 
 
385 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2854  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.22 
 
 
385 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.715109  hitchhiker  0.0000000460252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3200  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.67 
 
 
385 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.393512  hitchhiker  0.00650034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2781  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.58 
 
 
385 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1475  butyryl-CoA dehydrogenase  67.18 
 
 
385 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0220  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.3 
 
 
388 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.581384  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0949  acyl-CoA dehydrogenase-like  65.63 
 
 
385 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0416018  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000373  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  68.6 
 
 
384 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001547  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  67.02 
 
 
384 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2132  butyryl-CoA dehydrogenase  67.01 
 
 
388 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627987  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05484  acyl-CoA dehydrogenase  68.87 
 
 
384 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.79 
 
 
387 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178062  normal  0.0980928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.33 
 
 
388 aa  501  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0901  putative acyl-CoA dehydrogenase  62.37 
 
 
386 aa  500  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1516  butyryl-CoA dehydrogenase  62.11 
 
 
386 aa  498  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4774  acyl-CoA dehydrogenase  63.95 
 
 
387 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54630  acyl-CoA dehydrogenase  63.68 
 
 
387 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.84 
 
 
379 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350853  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.68 
 
 
379 aa  461  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1871  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.15 
 
 
385 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1275  acyl-CoA dehydrogenase  58.62 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3937  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.11 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.818683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1835  butyryl-CoA dehydrogenase  59.1 
 
 
379 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.571593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2120  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.82 
 
 
382 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.2 
 
 
378 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295515  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3301  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.05 
 
 
381 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0617  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.5 
 
 
380 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3579  acyl-CoA dehydrogenase  56.17 
 
 
381 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3093  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.35 
 
 
382 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2190  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.76 
 
 
380 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3784  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.38 
 
 
381 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0514629  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2558  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.12 
 
 
381 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0623  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.23 
 
 
391 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0650  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.38 
 
 
381 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2176  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.29 
 
 
380 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1103  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.15 
 
 
381 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2476  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.44 
 
 
380 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0589  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.5 
 
 
380 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02820  acyl-CoA dehydrogenase  51.99 
 
 
377 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0858  butyryl-CoA dehydrogenase  50.79 
 
 
380 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2158  acyl-CoA dehydrogenase  54.07 
 
 
381 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5011  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.07 
 
 
387 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117513  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0931  hypothetical protein  50.53 
 
 
384 aa  401  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0900  hypothetical protein  50.53 
 
 
384 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1361  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.53 
 
 
387 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237176  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.19 
 
 
382 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.98 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1063  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  51.47 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1090  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.47 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.992341  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.47 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0773066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1750  acyl-CoA dehydrogenase  54.05 
 
 
381 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.317107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3053  Acyl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 
381 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1789  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.85 
 
 
379 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0858072  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.07 
 
 
392 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1335  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.12 
 
 
379 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254429  normal  0.854455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0156  Acyl-CoA dehydrogenase  51.59 
 
 
379 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3069  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.27 
 
 
387 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.117634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1909  butyryl-CoA dehydrogenase  53.3 
 
 
381 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4480  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.77 
 
 
381 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.155011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10766  acyl-CoA dehydrogenase fadE9  51.18 
 
 
390 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000022778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.07 
 
 
375 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.04 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.73 
 
 
377 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.19 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.53 
 
 
375 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.53 
 
 
375 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.77 
 
 
376 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.87 
 
 
376 aa  316  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.7 
 
 
375 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.14 
 
 
380 aa  315  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.97 
 
 
392 aa  315  9e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  41.99 
 
 
379 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  44.59 
 
 
379 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.53 
 
 
375 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.12 
 
 
379 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
379 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
379 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
379 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.95 
 
 
386 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>