More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3220 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3220  DnaB domain-containing protein  100 
 
 		 456 aa  934    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150384  normal  0.300928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  38.04 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  38.39 
 
 		 472 aa  230  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  38.39 
 
 		 472 aa  230  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 472 aa  229  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  37.33 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  36.61 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  33.8 
 
 		 452 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  37.42 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  35.84 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  35.04 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  35.04 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2325  DnaB domain protein helicase domain protein  34.36 
 
 		 464 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0591718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  35.62 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  35.18 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  35.18 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  33.94 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  34.96 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  34.96 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  32.95 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  32.65 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  34.57 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  34.57 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  32.32 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  34.75 
 
 		 469 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  32.17 
 
 		 481 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  34.12 
 
 		 463 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  34.48 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  32.11 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  34.48 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  32.67 
 
 		 468 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  32.44 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  34.48 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  34.5 
 
 		 473 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  34.89 
 
 		 463 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  32.1 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  35.78 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  34.1 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  31.78 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  33.64 
 
 		 461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  31.84 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  35.07 
 
 		 465 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  32.99 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  32.01 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  32.82 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  32.52 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  36.02 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  31.56 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  31.11 
 
 		 468 aa  196  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  31.78 
 
 		 468 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  32.22 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  31.35 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  32.22 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  32.03 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  31.33 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  31.33 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  31.33 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  31.93 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  32.22 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  32.22 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  31.33 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  32 
 
 		 468 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  30.07 
 
 		 451 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  30.44 
 
 		 448 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  32.89 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  30.9 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2624  replicative DNA helicase  32.81 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  30.73 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  33.04 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  32.8 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  31.69 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  33.26 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  34.32 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  31.93 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  33.04 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  36.19 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  32.47 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  31.48 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  32.2 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  31.8 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  32.23 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  31.88 
 
 		 498 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  31.94 
 
 		 469 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  32.35 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  34.95 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  31.38 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  33.07 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>