205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2379 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2379  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 493 aa  1032    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.883563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5400  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.94 
 
 		 498 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2063  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.39 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4634  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.04 
 
 		 476 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1321  rubredoxin  30.69 
 
 		 490 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.920008  normal  0.0714632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  55.32 
 
 		 52 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 		 52 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.36 
 
 		 237 aa  57  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 		 53 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34 
 
 		 140 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 52 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.11 
 
 		 53 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 		 58 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  36.76 
 
 		 237 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 		 100 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 		 52 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 		 54 aa  54.7  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  46 
 
 		 57 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.68 
 
 		 227 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 		 229 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 		 137 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 		 52 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 		 53 aa  53.9  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 237 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 237 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 		 52 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0750  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 52 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000427442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 52 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 52 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.39 
 
 		 415 aa  53.5  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 54 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 		 53 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  47.73 
 
 		 237 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 		 52 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 		 53 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 52 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0735  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 52 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  47.73 
 
 		 52 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 65 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 52 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  44.44 
 
 		 53 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 		 53 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50520  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein, HoxR  45.28 
 
 		 72 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0418213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 		 284 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 52 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.71 
 
 		 72 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0604584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 		 74 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 		 50 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3765  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 		 70 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  46.81 
 
 		 81 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 52 aa  51.2  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 52 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 56 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 52 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 74 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 		 480 aa  51.2  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  42.22 
 
 		 53 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 		 52 aa  50.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 		 52 aa  50.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 60 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0779  rubredoxin  42.55 
 
 		 53 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000850619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0755  rubredoxin  42.55 
 
 		 53 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000950456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.35 
 
 		 59 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.67 
 
 		 55 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.82 
 
 		 591 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2386  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.87 
 
 		 65 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 60 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 60 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  43.48 
 
 		 56 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  43.75 
 
 		 56 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  44.44 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  45.45 
 
 		 52 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.58 
 
 		 52 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  46.81 
 
 		 105 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.46 
 
 		 115 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  40.74 
 
 		 63 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  44.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.46 
 
 		 115 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 63 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2003  rubredoxin  45.83 
 
 		 69 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165789  normal  0.805568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 		 54 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 		 70 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 		 53 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  44.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  44.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  42.86 
 
 		 55 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  44.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 		 53 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 		 60 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3982  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 		 66 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09560  rubredoxin  51.22 
 
 		 52 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00690016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 		 52 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 		 56 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  40 
 
 		 53 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.51 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 58 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 		 52 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>