88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4634 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4634  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 476 aa  975    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5400  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.54 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2379  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.04 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.883563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2063  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.37 
 
 		 494 aa  285  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1321  rubredoxin  31.3 
 
 		 490 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.920008  normal  0.0714632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1240  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 55 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3982  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 		 66 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 		 52 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2386  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 		 65 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.73 
 
 		 353 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.69 
 
 		 58 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.73 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.73 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.73 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.73 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  37.25 
 
 		 58 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.07 
 
 		 172 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.07 
 
 		 172 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.36 
 
 		 58 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1804  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 		 64 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.839572  normal  0.255505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 		 53 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 60 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 52 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.98 
 
 		 114 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 		 52 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.29 
 
 		 110 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  42 
 
 		 56 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2937  rubredoxin  41.67 
 
 		 53 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00804477  normal  0.0175439 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  33.33 
 
 		 138 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.78 
 
 		 591 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.96 
 
 		 62 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 52 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.73 
 
 		 445 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  39.58 
 
 		 237 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 		 53 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.74 
 
 		 62 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 54 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  40.43 
 
 		 53 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.91 
 
 		 74 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.12 
 
 		 227 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2644  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 		 59 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.59 
 
 		 127 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.87 
 
 		 195 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  44.23 
 
 		 51 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36 
 
 		 54 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  37.25 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 52 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.67 
 
 		 53 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 52 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 		 52 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  38.64 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  38 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.33 
 
 		 58 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.29 
 
 		 75 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.25 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.71 
 
 		 54 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0254  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 		 52 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.59 
 
 		 128 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.85 
 
 		 75 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.62 
 
 		 52 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.25 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.54 
 
 		 56 aa  44.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.91 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.74 
 
 		 54 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3765  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.92 
 
 		 70 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 58 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 52 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  37.31 
 
 		 229 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.85 
 
 		 75 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 52 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.19 
 
 		 65 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.3 
 
 		 52 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 		 462 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.3 
 
 		 52 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34 
 
 		 54 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  32.73 
 
 		 56 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 53 aa  43.5  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.43 
 
 		 52 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.64 
 
 		 235 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.3 
 
 		 52 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  36.73 
 
 		 52 aa  43.5  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>