29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5400 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5400  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 498 aa  1050    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2063  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.91 
 
 		 494 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2379  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.94 
 
 		 493 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.883563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4634  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.54 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1321  rubredoxin  30.51 
 
 		 490 aa  226  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.920008  normal  0.0714632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3765  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 		 70 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.92 
 
 		 57 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  42.11 
 
 		 245 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.85 
 
 		 57 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.33 
 
 		 114 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  42.86 
 
 		 55 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.35 
 
 		 252 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  40.35 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  34.48 
 
 		 229 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  37.7 
 
 		 55 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35 
 
 		 53 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  37.29 
 
 		 50 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35 
 
 		 53 aa  44.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2003  rubredoxin  38.98 
 
 		 69 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165789  normal  0.805568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 		 127 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 57 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  32.79 
 
 		 58 aa  44.3  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.1 
 
 		 53 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1162  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 70 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0573132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2803  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.33 
 
 		 52 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.2 
 
 		 110 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.1 
 
 		 53 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.1 
 
 		 53 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>