More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2386 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2386  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
65 aa  136  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  50 
 
 
591 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.25 
 
 
52 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1240  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  46.94 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.9 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1804  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.839572  normal  0.255505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
284 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
52 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.94 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
54 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  50 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
480 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 
229 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
52 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.98 
 
 
58 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0248  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0899608 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.67 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.29 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  44.23 
 
 
243 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
52 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.83 
 
 
589 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.55 
 
 
227 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  44.23 
 
 
237 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.68 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
53 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1931  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
52 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  48.94 
 
 
52 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.02 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.06 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
53 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  37.5 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  52.17 
 
 
52 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  54.35 
 
 
53 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
52 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2111  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
54 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
235 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  50 
 
 
52 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.28 
 
 
54 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.81 
 
 
641 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2937  rubredoxin  44 
 
 
53 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00804477  normal  0.0175439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  47.83 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  47.83 
 
 
52 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
56 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 
58 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
52 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
53 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  44 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
52 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2107  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4634  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
476 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.18 
 
 
505 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  41.67 
 
 
494 aa  52  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  40.38 
 
 
503 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0779  rubredoxin  42 
 
 
53 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000850619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  46.81 
 
 
52 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  44.44 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  40 
 
 
479 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  46.81 
 
 
353 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
455 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
52 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.1 
 
 
479 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
58 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2021  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
54 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000050094  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
70 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.1 
 
 
51 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.789943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  43.18 
 
 
498 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
58 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  46.81 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  46.81 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>