More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1083 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1083  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00389422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1569  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0053  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 
214 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.633945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  35.35 
 
 
218 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.1 
 
 
214 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  30.92 
 
 
217 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3979  ABC transporter related  36.5 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  35.12 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  29.47 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  25.71 
 
 
303 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  27.93 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0363  ABC transporter related  27.72 
 
 
219 aa  96.3  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.31 
 
 
331 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  25.31 
 
 
303 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  25.31 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  25.31 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  27.59 
 
 
303 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  25.31 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  31.08 
 
 
303 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  23.29 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  28.78 
 
 
306 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  27.09 
 
 
306 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  25.37 
 
 
312 aa  85.9  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  25.1 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  27.59 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  28 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  30.63 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  30.56 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  26.87 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  27.98 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  27.94 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  26.84 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  27.57 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  25.37 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  28.71 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
305 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  24.76 
 
 
305 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  28.51 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  28.65 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  26.41 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  25.94 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  28.65 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  27.1 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  24.87 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  29.17 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  26.79 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  25.74 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2286  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.97 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0840896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  32.14 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  27.03 
 
 
315 aa  79  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
307 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
307 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  28.57 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  22.76 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  25.78 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  27.66 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  23.25 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  25.78 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  25.6 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  25.49 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0301  ABC transporter related  26.32 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  22.93 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  29.17 
 
 
318 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  23.53 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  22.66 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  21.43 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  22.27 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  27.23 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  23.55 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  25 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04340  ABC transporter related  29.07 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  24.47 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  23.66 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  26.82 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  30 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  25.93 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  25.26 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  25.62 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  27.6 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>