28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2250 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  100 
 
 		 90 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  39.51 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  38.27 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  38.27 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  38.27 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  38.27 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  39.73 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  35.44 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  37.97 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  35.44 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  37.66 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  36.49 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.56 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  30.59 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  29.07 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  32.93 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  37.66 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  29.49 
 
 		 195 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  32.53 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  39.74 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  30.26 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  29.63 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  28.75 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>