24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3369 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  51.81 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  50.6 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  49.41 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  50 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  51.32 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  48.28 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  51.32 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  51.32 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  37.65 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  43.24 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  37.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  32.5 
 
 		 195 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  37.5 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  34.52 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.47 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  34.62 
 
 		 217 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  35.71 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  29.07 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  32.88 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1352  TfoX domain protein  31.46 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.499558 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  32.43 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  31.03 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>