18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0463 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  100 
 
 		 120 aa  243  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  64.22 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  48.05 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  47.5 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  48.05 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  46.75 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  48.05 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  45.45 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  46.75 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  43.9 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  54.84 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  37.65 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  41.77 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  36.49 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3115  TfoX family regulatory protein  45.95 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.897384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0958  TfoX domain-containing protein  29.57 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1352  TfoX domain protein  31.78 
 
 		 109 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.499558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.88 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>