25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4795 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  100 
 
 		 90 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  83.33 
 
 		 92 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  83.33 
 
 		 92 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  82.02 
 
 		 92 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  82.02 
 
 		 92 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  75.56 
 
 		 90 aa  139  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  73.33 
 
 		 90 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  49.41 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  46.84 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  43.9 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  39.51 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  44.12 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  41.25 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  41.33 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  35.37 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  36.84 
 
 		 187 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0958  TfoX domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1825  TfoX-like  36.47 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  36.49 
 
 		 196 aa  47.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  36.49 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  30.23 
 
 		 208 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0312  hypothetical protein  32 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>