20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  183  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  97.78 
 
 		 90 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  80 
 
 		 90 aa  143  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  73.33 
 
 		 90 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  74.7 
 
 		 92 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  71.11 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  75.61 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  71.11 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  51.81 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  46.75 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  41.38 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  43.42 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  40.54 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  40.54 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  35.44 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  35.53 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  38.57 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  32.89 
 
 		 195 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  34.25 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>