20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03141 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  64.22 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  46.84 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  44.87 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  44.87 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  44.74 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  43.59 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  43.59 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  40.23 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  44.16 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  44 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  37.33 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  39.73 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  37.14 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  35.48 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  36.07 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3115  TfoX family regulatory protein  43.48 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.897384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1825  TfoX-like  35.44 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0312  hypothetical protein  35.62 
 
 		 101 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>