17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1825 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1825  TfoX-like  100 
 
 		 120 aa  246  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0958  TfoX domain-containing protein  55.05 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1352  TfoX domain protein  52.38 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.499558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  36.47 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  40.24 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  40.24 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  40.24 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  39.02 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5419  hypothetical protein  31.76 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00856887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0999  TfoX domain-containing protein  34.15 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000838454  unclonable  5.09937e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62250  hypothetical protein  31.33 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397585  normal  0.289473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  35.44 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  38.1 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3369  TonB-like  31.82 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0479291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0463  TfoX domain protein  30.77 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000116495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  37.29 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  31.25 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>