More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1534 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1534  Inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
237 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160289  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1854  Inorganic pyrophosphatase  43.87 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13228  inorganic pyrophosphatase  44.34 
 
 
134 aa  95.5  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.829659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2390  inorganic diphosphatase  33.51 
 
 
186 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.138503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3373  Inorganic diphosphatase  32.28 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  35.59 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3108  inorganic pyrophosphatase  36.99 
 
 
176 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1083  inorganic diphosphatase  37.14 
 
 
176 aa  89  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  34.73 
 
 
184 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  33.33 
 
 
183 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2049  inorganic diphosphatase  33.51 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.863181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1296  inorganic pyrophosphatase  36.42 
 
 
176 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1233  inorganic diphosphatase  32.95 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  34.73 
 
 
184 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4067  Inorganic diphosphatase  35.06 
 
 
183 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.491651  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5439  Inorganic diphosphatase  33.33 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.706017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0971  inorganic diphosphatase  35.8 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.789012  hitchhiker  0.000000869689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0903  Inorganic diphosphatase  34.5 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0444  inorganic pyrophosphatase  35.29 
 
 
181 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0113658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  31.98 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  34.78 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1188  Inorganic diphosphatase  33.14 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0788222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  32.74 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1577  Inorganic diphosphatase  33.52 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2042  inorganic diphosphatase  39.44 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  33.71 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1560  Inorganic diphosphatase  32.79 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28321  normal  0.553892 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55811  Inorganic pyrophosphatase, mitochondrial precursor (Pyrophosphate phospho-hydrolase) (PPase)  31.47 
 
 
332 aa  79  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0127714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  35.8 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  35.8 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  31.95 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0495  putative inorganic pyrophosphatase  35.26 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.648632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  35.8 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  32.95 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1182  inorganic diphosphatase  33.72 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05581  putative inorganic pyrophosphatase  34.1 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05511  putative inorganic pyrophosphatase  35.12 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0629399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  35.52 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  30.46 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf269  inorganic pyrophosphatase  34.18 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.947128  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05211  putative inorganic pyrophosphatase  35.12 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1277  inorganic diphosphatase  36.81 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  30.46 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  32.39 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5121  inorganic pyrophosphatase  31.69 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.551351  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0793  Inorganic diphosphatase  40.95 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  35.29 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2409  Inorganic diphosphatase  31.69 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  32 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  34.34 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  35.29 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  33.57 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0470  inorganic diphosphatase  30.94 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0790393  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  29.82 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  32 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  32.09 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3432  inorganic pyrophosphatase  32.79 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  32.42 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  32.42 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  35.09 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  36.59 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  31.03 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  31.43 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1978  inorganic diphosphatase  31.03 
 
 
172 aa  72  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  37.5 
 
 
179 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  36.59 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1827  putative inorganic pyrophosphatase  32.54 
 
 
195 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05511  putative inorganic pyrophosphatase  32.16 
 
 
195 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.398935 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0677  inorganic diphosphatase  33.54 
 
 
195 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  32.97 
 
 
175 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  32.42 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  31.21 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  32.39 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0743  inorganic diphosphatase  31.79 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0640  inorganic pyrophosphatase  31.79 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0416905  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40612  predicted protein  32.89 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  30.81 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  34.51 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  35.77 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  34.51 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  30.64 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  30.23 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  34.51 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  29.63 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  33.33 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  34.51 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  32 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  32.86 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1684  inorganic diphosphatase  32.54 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  32.86 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  35.77 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07251  putative inorganic pyrophosphatase  31.95 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  34.17 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19901  predicted protein  31.52 
 
 
900 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  39.25 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  39.25 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  30.18 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  29.31 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  32.88 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  36.36 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>