More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3667 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  100 
 
 
183 aa  379  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  69.61 
 
 
184 aa  285  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4067  Inorganic diphosphatase  50.29 
 
 
183 aa  197  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.491651  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3108  inorganic pyrophosphatase  50.29 
 
 
176 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2042  inorganic diphosphatase  58.28 
 
 
178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5439  Inorganic diphosphatase  52.05 
 
 
181 aa  187  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.706017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1577  Inorganic diphosphatase  51.5 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  48 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1188  Inorganic diphosphatase  50.3 
 
 
189 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0788222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0444  inorganic pyrophosphatase  48.81 
 
 
181 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0113658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0793  Inorganic diphosphatase  51.19 
 
 
177 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1182  inorganic diphosphatase  50 
 
 
177 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  48.57 
 
 
206 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  48.57 
 
 
206 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  48.57 
 
 
206 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0903  Inorganic diphosphatase  47.31 
 
 
188 aa  170  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  47.43 
 
 
215 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1277  inorganic diphosphatase  49.1 
 
 
185 aa  168  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  47.37 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  46.71 
 
 
179 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  50 
 
 
184 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  49.32 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  43.64 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  42.41 
 
 
167 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  42.51 
 
 
172 aa  143  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  42.59 
 
 
172 aa  143  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  41.14 
 
 
167 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  42.94 
 
 
170 aa  141  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  46.15 
 
 
176 aa  141  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  41.77 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  40.46 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  46.1 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  46.1 
 
 
211 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  40.34 
 
 
181 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  40.34 
 
 
181 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  46.1 
 
 
211 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  43.21 
 
 
169 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0666  inorganic pyrophosphatase  40.74 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.127222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  42.5 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  40.49 
 
 
170 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  40.49 
 
 
170 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  42.41 
 
 
165 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0741  inorganic pyrophosphatase  40.12 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  44.74 
 
 
177 aa  137  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1361  inorganic pyrophosphatase  39.51 
 
 
172 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.554258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2590  Inorganic diphosphatase  39.31 
 
 
176 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  45.4 
 
 
171 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0470  inorganic diphosphatase  41.88 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0790393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  40.12 
 
 
170 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1978  inorganic diphosphatase  41.25 
 
 
172 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  38.73 
 
 
177 aa  134  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  44.24 
 
 
173 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  44.24 
 
 
173 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  41.21 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  41.18 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  42.26 
 
 
177 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3548  inorganic pyrophosphatase  39.88 
 
 
169 aa  131  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  41.57 
 
 
172 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  39.66 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  41.07 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2613  inorganic pyrophosphatase  42.26 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  41.72 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  40.99 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1519  inorganic diphosphatase  39.39 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1975  Inorganic diphosphatase  40.23 
 
 
178 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  40.7 
 
 
175 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  42.42 
 
 
174 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  40.7 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  42.58 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  40.49 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  40.59 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  39.41 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  40.59 
 
 
178 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  41.62 
 
 
175 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl544  inorganic pyrophosphatase  39.49 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000184508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  40.7 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  39.66 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  39.31 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  39.77 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  39.88 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0678  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  40.7 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  43.24 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  39.24 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  39.52 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  41.62 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2972  inorganic diphosphatase  38.64 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  41.82 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  41.42 
 
 
175 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  39.64 
 
 
177 aa  125  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  41.94 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  39.31 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  43.21 
 
 
171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  38.6 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  39.08 
 
 
175 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  42.77 
 
 
174 aa  124  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  45.81 
 
 
170 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  39.88 
 
 
177 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  39.29 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>