More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3108 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3108  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5439  Inorganic diphosphatase  69.94 
 
 
181 aa  259  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.706017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4067  Inorganic diphosphatase  63.22 
 
 
183 aa  235  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.491651  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0444  inorganic pyrophosphatase  60.69 
 
 
181 aa  220  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0113658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1182  inorganic diphosphatase  60.12 
 
 
177 aa  217  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0793  Inorganic diphosphatase  60.34 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1577  Inorganic diphosphatase  58.96 
 
 
177 aa  213  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1277  inorganic diphosphatase  60.69 
 
 
185 aa  213  9e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  58.82 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  58.24 
 
 
206 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  58.24 
 
 
206 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  58.24 
 
 
206 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1188  Inorganic diphosphatase  56.65 
 
 
189 aa  208  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0788222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0903  Inorganic diphosphatase  56.07 
 
 
188 aa  205  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  52.84 
 
 
178 aa  202  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  50.29 
 
 
183 aa  189  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  47.16 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2042  inorganic diphosphatase  48.85 
 
 
178 aa  174  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  47.5 
 
 
184 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  45.56 
 
 
183 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  50 
 
 
184 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  44.57 
 
 
179 aa  157  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  44.23 
 
 
167 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  45.28 
 
 
170 aa  147  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  44.23 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  43.4 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  39.77 
 
 
177 aa  143  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2590  Inorganic diphosphatase  38.86 
 
 
176 aa  140  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  46.67 
 
 
169 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  40.35 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  41.38 
 
 
178 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  40.45 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  41.29 
 
 
170 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  41.29 
 
 
170 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  40.99 
 
 
171 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05511  putative inorganic pyrophosphatase  43.71 
 
 
195 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0629399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  45.52 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  45.86 
 
 
176 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05211  putative inorganic pyrophosphatase  44.24 
 
 
195 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  43.23 
 
 
211 aa  134  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0495  putative inorganic pyrophosphatase  44.85 
 
 
195 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.648632  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  45.4 
 
 
172 aa  134  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3548  inorganic pyrophosphatase  41.4 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  42.68 
 
 
211 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  48.94 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  42.77 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  41.57 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05581  putative inorganic pyrophosphatase  43.37 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  40.96 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  45.64 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  45.51 
 
 
177 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  43.59 
 
 
162 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  43.59 
 
 
162 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  43.31 
 
 
173 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  43.59 
 
 
162 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  42.24 
 
 
173 aa  131  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  40.36 
 
 
177 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  45.64 
 
 
163 aa  131  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  39.18 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  41.92 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  41.92 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  42.68 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  43.62 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  43.45 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  41.95 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  43.33 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  43.64 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  44.97 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  40.83 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  44.97 
 
 
180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 
199 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  40.96 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
178 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  40.35 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  40.36 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  42.59 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  40.36 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  44.3 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  43.11 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07251  putative inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  42.95 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1827  putative inorganic pyrophosphatase  42.42 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1684  inorganic diphosphatase  44.3 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  45.39 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0741  inorganic pyrophosphatase  40.24 
 
 
172 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  43.9 
 
 
175 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05511  putative inorganic pyrophosphatase  42.42 
 
 
195 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.398935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  40.96 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  42.26 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0666  inorganic pyrophosphatase  41.25 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.127222  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  42.95 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  44.74 
 
 
175 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0677  inorganic diphosphatase  41.92 
 
 
195 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1361  inorganic pyrophosphatase  41.25 
 
 
172 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.554258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  40.72 
 
 
177 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  42.95 
 
 
175 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  42.58 
 
 
168 aa  124  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>