More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0611 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  100 
 
 
164 aa  340  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  83.02 
 
 
163 aa  280  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  82.69 
 
 
168 aa  274  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  79.5 
 
 
162 aa  274  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  77.44 
 
 
171 aa  270  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  79.14 
 
 
168 aa  268  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  79.14 
 
 
168 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  79.14 
 
 
165 aa  266  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  77.3 
 
 
175 aa  266  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  77.44 
 
 
164 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  78.12 
 
 
165 aa  263  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  80 
 
 
173 aa  262  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  78.88 
 
 
168 aa  261  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  76.88 
 
 
170 aa  259  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  80.5 
 
 
167 aa  258  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  75 
 
 
167 aa  256  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  74.53 
 
 
179 aa  255  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  76.28 
 
 
170 aa  254  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  76.28 
 
 
179 aa  253  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  73.91 
 
 
180 aa  251  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  78.47 
 
 
161 aa  250  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  72.44 
 
 
171 aa  248  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  73.89 
 
 
170 aa  247  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  69.64 
 
 
169 aa  244  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  66.88 
 
 
200 aa  222  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  66.67 
 
 
162 aa  221  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  66.03 
 
 
161 aa  216  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  66.03 
 
 
161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  63.46 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  61.35 
 
 
162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  61.35 
 
 
162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  61.54 
 
 
162 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  63.76 
 
 
166 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  60.62 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  60.65 
 
 
164 aa  192  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  56.41 
 
 
190 aa  185  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  59.12 
 
 
195 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  55.13 
 
 
169 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  60.51 
 
 
162 aa  177  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  60.51 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  56.13 
 
 
169 aa  176  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  49.06 
 
 
176 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  48.43 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  49.37 
 
 
179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  55.15 
 
 
211 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  50.97 
 
 
168 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  52.86 
 
 
211 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  52.86 
 
 
211 aa  154  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  48.43 
 
 
174 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  45.86 
 
 
178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  47.37 
 
 
170 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  47.13 
 
 
174 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  49.66 
 
 
170 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  44.52 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  50.34 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  44.72 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  47.8 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  48.63 
 
 
170 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  48.63 
 
 
170 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  50 
 
 
169 aa  143  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  47.71 
 
 
167 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  46.91 
 
 
182 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  46.45 
 
 
167 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
178 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  44.79 
 
 
179 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
178 aa  140  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
175 aa  140  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  46.71 
 
 
183 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  45.16 
 
 
165 aa  140  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1519  inorganic diphosphatase  48.28 
 
 
170 aa  140  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  49.64 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  46.36 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1663  inorganic diphosphatase  47.83 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  50.74 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
165 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
175 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  43.48 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3548  inorganic pyrophosphatase  43.79 
 
 
169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  47.13 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  50 
 
 
184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  44.87 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
178 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  44.74 
 
 
173 aa  137  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  45.86 
 
 
173 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  45.86 
 
 
173 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05691  inorganic pyrophosphatase  48.55 
 
 
175 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1844  inorganic pyrophosphatase  48.55 
 
 
175 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.549684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  45.57 
 
 
178 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  44.94 
 
 
177 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  46.36 
 
 
175 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  46.36 
 
 
175 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  44.94 
 
 
178 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05121  inorganic pyrophosphatase  48.18 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05681  inorganic pyrophosphatase  48.18 
 
 
184 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0512  inorganic pyrophosphatase  48.18 
 
 
184 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05381  inorganic pyrophosphatase  48.18 
 
 
184 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>