More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3708 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  100 
 
 
184 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  97.28 
 
 
184 aa  377  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  79.01 
 
 
183 aa  314  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  58.24 
 
 
178 aa  209  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  52.33 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  52.05 
 
 
177 aa  190  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  51.45 
 
 
178 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2590  Inorganic diphosphatase  50.88 
 
 
176 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  50.29 
 
 
177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5439  Inorganic diphosphatase  45.61 
 
 
181 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.706017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1577  Inorganic diphosphatase  45.93 
 
 
177 aa  169  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1277  inorganic diphosphatase  44.19 
 
 
185 aa  164  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  53.15 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0793  Inorganic diphosphatase  44.77 
 
 
177 aa  164  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  48.7 
 
 
175 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 
211 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  48.77 
 
 
211 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1182  inorganic diphosphatase  44.77 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  47.44 
 
 
176 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  50 
 
 
170 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  47.77 
 
 
170 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3108  inorganic pyrophosphatase  47.5 
 
 
176 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  54.23 
 
 
169 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  49.69 
 
 
171 aa  158  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1204  Inorganic diphosphatase  49.43 
 
 
178 aa  157  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1188  Inorganic diphosphatase  43.6 
 
 
189 aa  157  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0788222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  51.41 
 
 
170 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  51.41 
 
 
170 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0903  Inorganic diphosphatase  43.6 
 
 
188 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0444  inorganic pyrophosphatase  45.35 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0113658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  46.54 
 
 
167 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  45.28 
 
 
167 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3548  inorganic pyrophosphatase  47.13 
 
 
169 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4067  Inorganic diphosphatase  48.28 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.491651  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1519  inorganic diphosphatase  48.95 
 
 
170 aa  150  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  50.33 
 
 
171 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  52 
 
 
179 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  46.45 
 
 
162 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1663  inorganic diphosphatase  47.74 
 
 
169 aa  148  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  49.32 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  48.39 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  43.27 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  46.54 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0695  inorganic diphosphatase  46.36 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  46.54 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  48.94 
 
 
174 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
171 aa  144  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  44.44 
 
 
206 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  47.47 
 
 
170 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  44.44 
 
 
206 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05691  inorganic pyrophosphatase  44.65 
 
 
175 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1844  inorganic pyrophosphatase  44.65 
 
 
175 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.549684  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05381  inorganic pyrophosphatase  46.71 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  54.41 
 
 
161 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0512  inorganic pyrophosphatase  46.71 
 
 
184 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  46.84 
 
 
167 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05681  inorganic pyrophosphatase  46.71 
 
 
184 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  47.68 
 
 
175 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  44.87 
 
 
169 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  43.83 
 
 
206 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05121  inorganic pyrophosphatase  48.57 
 
 
175 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  44.65 
 
 
165 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05751  inorganic pyrophosphatase  45.51 
 
 
182 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  45.51 
 
 
173 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  47.02 
 
 
171 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  43.21 
 
 
215 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  50.74 
 
 
168 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  42.51 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  50.74 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  43.64 
 
 
199 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  46.75 
 
 
162 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  46.75 
 
 
162 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  46.75 
 
 
162 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  41.42 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  43.21 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  42.33 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  44.31 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  43.4 
 
 
165 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  47.68 
 
 
168 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  47.26 
 
 
163 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  43.18 
 
 
177 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  43.64 
 
 
174 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2042  inorganic diphosphatase  46 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  42.24 
 
 
168 aa  137  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  49.32 
 
 
168 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  41.42 
 
 
178 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  43.04 
 
 
169 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  45.81 
 
 
200 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  42.94 
 
 
178 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  47.71 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  42.94 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  43.83 
 
 
174 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  41.52 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  41.52 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  41.52 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  41.52 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  47.26 
 
 
165 aa  134  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  41.04 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  48.53 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>