More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4310 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  88.33 
 
 		 180 aa  322  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  82.61 
 
 		 168 aa  277  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  81.99 
 
 		 168 aa  275  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  82.69 
 
 		 168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  77.02 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  78.75 
 
 		 171 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  77.5 
 
 		 175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  77.16 
 
 		 167 aa  262  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  76.73 
 
 		 163 aa  261  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  78.62 
 
 		 167 aa  256  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  73.94 
 
 		 170 aa  256  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  74.53 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  75 
 
 		 170 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  70.22 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  73.72 
 
 		 171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  72.62 
 
 		 168 aa  250  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  72.29 
 
 		 173 aa  249  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  75 
 
 		 164 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  73.75 
 
 		 165 aa  247  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  76.28 
 
 		 165 aa  244  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  78.32 
 
 		 161 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  71.78 
 
 		 170 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  67.86 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  63.92 
 
 		 162 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  57.46 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  58.93 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  58.93 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  59.04 
 
 		 170 aa  204  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  58.33 
 
 		 162 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  62.03 
 
 		 161 aa  204  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  62.03 
 
 		 161 aa  201  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  62.42 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  57.5 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  57.05 
 
 		 164 aa  191  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  58.22 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  54.78 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  58.6 
 
 		 195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  53.46 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  53.99 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  60.51 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  58.39 
 
 		 162 aa  174  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  53.7 
 
 		 211 aa  173  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  53.7 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  52.15 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  54.43 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  50 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  48.1 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  50.32 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  48.78 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  48.41 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  48.41 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  49.06 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  45 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  46.54 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 		 165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  42.68 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  47.17 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  45.91 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  45.22 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  47.22 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  42.07 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  43.12 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  45.39 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  48.57 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  42.86 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  45.06 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  45.45 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  49.63 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  46.41 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  42.69 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  46.21 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  47.86 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  47.86 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  42.14 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  44.94 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  49.29 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  43.23 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  45.1 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  41.72 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  43.67 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0743  inorganic diphosphatase  45.34 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0640  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0416905  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  43.04 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  43.56 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  43.87 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2606  Inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  44.52 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>