More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4313 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  99.4 
 
 
168 aa  342  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  81.55 
 
 
175 aa  289  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  83.23 
 
 
170 aa  286  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  83.03 
 
 
167 aa  284  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  85.9 
 
 
168 aa  283  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  83.23 
 
 
162 aa  280  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  82.61 
 
 
179 aa  277  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  79.39 
 
 
171 aa  275  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  81.13 
 
 
163 aa  270  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  80.12 
 
 
180 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  79.14 
 
 
164 aa  268  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  78.85 
 
 
171 aa  264  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  82.1 
 
 
167 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  78.26 
 
 
168 aa  254  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  76.73 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  75.62 
 
 
170 aa  252  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  76.07 
 
 
164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  75.62 
 
 
165 aa  250  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  75 
 
 
165 aa  249  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  71.69 
 
 
173 aa  246  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  79.02 
 
 
161 aa  245  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  73.25 
 
 
170 aa  236  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  67.86 
 
 
169 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  66.03 
 
 
161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  66.03 
 
 
162 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  66.67 
 
 
161 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  65.77 
 
 
166 aa  207  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  63.12 
 
 
200 aa  207  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  61.35 
 
 
162 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  61.35 
 
 
162 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  60.74 
 
 
162 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  62.18 
 
 
170 aa  205  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  59.63 
 
 
164 aa  201  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  60 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  58.6 
 
 
195 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  55.13 
 
 
190 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  57.53 
 
 
169 aa  179  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  52.15 
 
 
169 aa  174  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  60.51 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  59.87 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  52.83 
 
 
175 aa  169  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  50.93 
 
 
174 aa  164  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  51.25 
 
 
176 aa  164  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  52.53 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  52.47 
 
 
168 aa  160  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  55.94 
 
 
211 aa  157  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  55.24 
 
 
211 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  48.75 
 
 
174 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  55.24 
 
 
211 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  49.38 
 
 
179 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  46.63 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  47.13 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  46.34 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  46.58 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  47.13 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  45.96 
 
 
175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  45.34 
 
 
179 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  47.1 
 
 
171 aa  144  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  46.91 
 
 
177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
175 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  46.58 
 
 
176 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  49.34 
 
 
183 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  46.84 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  45.51 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  47.71 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  45.51 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  47.71 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  42.95 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  45.06 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  45.39 
 
 
170 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  43.95 
 
 
178 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  47.92 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1663  inorganic diphosphatase  47.83 
 
 
169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  47.68 
 
 
184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
165 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  46.34 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 
175 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  48.91 
 
 
174 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  43.59 
 
 
171 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  47.02 
 
 
184 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>