More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4023 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  100 
 
 
170 aa  348  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  69.38 
 
 
162 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  69.38 
 
 
162 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  69.38 
 
 
162 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  69.81 
 
 
162 aa  235  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  70 
 
 
161 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  69.38 
 
 
161 aa  225  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  70.27 
 
 
166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  62.8 
 
 
170 aa  215  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  63.69 
 
 
163 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  65.38 
 
 
168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  64.74 
 
 
162 aa  213  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  66.88 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  64.74 
 
 
175 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  61.35 
 
 
171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  64.74 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  63.46 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  65.38 
 
 
164 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  61.73 
 
 
173 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  62.42 
 
 
167 aa  208  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  64.78 
 
 
164 aa  208  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  65.38 
 
 
164 aa  207  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  64.1 
 
 
165 aa  207  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  58.9 
 
 
169 aa  206  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  64.78 
 
 
165 aa  206  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  59.04 
 
 
179 aa  204  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  62.18 
 
 
168 aa  205  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  61.59 
 
 
167 aa  204  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  64.63 
 
 
168 aa  204  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  63.46 
 
 
168 aa  203  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  55.36 
 
 
171 aa  202  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  60.51 
 
 
180 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  62.82 
 
 
170 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  58.43 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  59.75 
 
 
161 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  60.51 
 
 
162 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  59.87 
 
 
162 aa  181  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  58.18 
 
 
195 aa  180  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  57.52 
 
 
169 aa  179  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  54.14 
 
 
190 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  47.27 
 
 
169 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  47.1 
 
 
176 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 
178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  46.79 
 
 
174 aa  151  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  48.03 
 
 
173 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  48.03 
 
 
173 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  45.51 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  47.4 
 
 
168 aa  150  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  46.67 
 
 
182 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  46.75 
 
 
175 aa  149  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  49.35 
 
 
176 aa  149  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  48.05 
 
 
167 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  46.3 
 
 
177 aa  148  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  43.21 
 
 
178 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  44.72 
 
 
177 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  47.4 
 
 
167 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  47.24 
 
 
211 aa  147  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  44.65 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  44.1 
 
 
178 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  44.65 
 
 
176 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  45.06 
 
 
179 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  46.1 
 
 
179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  46.2 
 
 
178 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  44.44 
 
 
176 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  47.13 
 
 
178 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  45.34 
 
 
178 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
178 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  44.44 
 
 
176 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
181 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  44.44 
 
 
176 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  48.08 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  48.08 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  44.44 
 
 
181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  47.74 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  43.83 
 
 
177 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  45.51 
 
 
178 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  45.75 
 
 
173 aa  142  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  45.51 
 
 
165 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
176 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  46.84 
 
 
178 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
177 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  43.64 
 
 
180 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  46.79 
 
 
165 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  45.64 
 
 
179 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  42.59 
 
 
179 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  46.5 
 
 
178 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  43.48 
 
 
178 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  42.59 
 
 
179 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
178 aa  141  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2972  inorganic diphosphatase  47.33 
 
 
179 aa  141  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  44.23 
 
 
181 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
178 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  44.23 
 
 
181 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
171 aa  140  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  42.41 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  44.52 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02598  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0743  inorganic diphosphatase  45.91 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>