More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2109 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  94.44 
 
 
165 aa  316  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  92.07 
 
 
164 aa  313  9e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  92.59 
 
 
165 aa  310  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  87.06 
 
 
168 aa  305  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  83.44 
 
 
170 aa  276  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  79.01 
 
 
162 aa  263  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  82.05 
 
 
168 aa  262  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  75.61 
 
 
171 aa  259  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  76.88 
 
 
164 aa  259  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  76.88 
 
 
167 aa  259  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  76.19 
 
 
173 aa  259  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  77.02 
 
 
175 aa  258  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  75.93 
 
 
163 aa  256  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  76.25 
 
 
168 aa  254  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  75 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  75.62 
 
 
168 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  75.62 
 
 
180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  72.35 
 
 
170 aa  247  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  74.68 
 
 
179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  76.1 
 
 
167 aa  241  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  70.51 
 
 
171 aa  239  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  76.92 
 
 
161 aa  237  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  70.44 
 
 
169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  64.81 
 
 
200 aa  215  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  67.09 
 
 
162 aa  213  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  66.05 
 
 
161 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  67.28 
 
 
161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  63.58 
 
 
162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  62.96 
 
 
162 aa  210  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  62.96 
 
 
162 aa  210  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  62.82 
 
 
170 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  58.75 
 
 
164 aa  200  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  58.49 
 
 
164 aa  198  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  64.43 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  54.09 
 
 
169 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  53.85 
 
 
190 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  56.44 
 
 
162 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  54.72 
 
 
195 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  55.21 
 
 
162 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  54.19 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  50.63 
 
 
175 aa  164  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  53.5 
 
 
211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  50 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  51.83 
 
 
211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  51.59 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  51.22 
 
 
211 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  53.33 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  48.12 
 
 
174 aa  153  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  46.84 
 
 
174 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
171 aa  145  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  46.25 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  46.63 
 
 
182 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  46.41 
 
 
178 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  44.17 
 
 
177 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  45.06 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  48.39 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  43.03 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  45.86 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
178 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  48.68 
 
 
173 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
175 aa  138  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  48.68 
 
 
173 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  45.06 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
178 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  47.77 
 
 
171 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  47.83 
 
 
170 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  46.05 
 
 
173 aa  136  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  48.1 
 
 
179 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  42.94 
 
 
178 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  45.81 
 
 
165 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0743  inorganic diphosphatase  45.96 
 
 
175 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0640  inorganic pyrophosphatase  45.96 
 
 
175 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0416905  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  46.1 
 
 
174 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0015  inorganic diphosphatase  44.44 
 
 
185 aa  134  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  48.2 
 
 
170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  48.2 
 
 
170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  45.16 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  43.75 
 
 
176 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  47.59 
 
 
170 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  46.15 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  46.15 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  45.91 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  45.16 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  45.91 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  43.21 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  40.49 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1473  inorganic diphosphatase  42.01 
 
 
178 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 
176 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1663  inorganic diphosphatase  47.1 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  48.2 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
175 aa  131  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  44.03 
 
 
178 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  44.65 
 
 
172 aa  130  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  41.1 
 
 
179 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1975  Inorganic diphosphatase  43.67 
 
 
178 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  46.58 
 
 
184 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  44.65 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  42.07 
 
 
206 aa  130  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>