More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0302 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  88.33 
 
 
179 aa  322  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  82.69 
 
 
168 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  78.88 
 
 
162 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  80.12 
 
 
168 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  79.52 
 
 
168 aa  268  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  77.84 
 
 
171 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  77.25 
 
 
167 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  75.62 
 
 
175 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  74.4 
 
 
170 aa  258  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  76.73 
 
 
163 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  77.5 
 
 
167 aa  257  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  74.36 
 
 
171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  73.91 
 
 
164 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  75.62 
 
 
170 aa  251  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  73.33 
 
 
165 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  75.78 
 
 
168 aa  248  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  76.88 
 
 
165 aa  247  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  74.38 
 
 
164 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  69.71 
 
 
179 aa  245  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  77.78 
 
 
161 aa  245  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  69.19 
 
 
173 aa  241  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  70.24 
 
 
170 aa  238  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  70.44 
 
 
169 aa  233  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  65.19 
 
 
162 aa  214  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  62.11 
 
 
200 aa  210  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  63.92 
 
 
161 aa  204  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  60.76 
 
 
162 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  60.51 
 
 
170 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  60.13 
 
 
162 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  60.13 
 
 
162 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  63.29 
 
 
161 aa  201  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  61.07 
 
 
166 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  56.88 
 
 
164 aa  190  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  56.96 
 
 
164 aa  189  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  52.38 
 
 
169 aa  181  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  54.78 
 
 
190 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  56.8 
 
 
195 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  54.32 
 
 
211 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  52.2 
 
 
175 aa  174  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  53.09 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  53.09 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  59.87 
 
 
162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  58.6 
 
 
162 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  51.83 
 
 
176 aa  170  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  52.23 
 
 
169 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  49.37 
 
 
179 aa  157  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  47.83 
 
 
168 aa  154  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  47.44 
 
 
175 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  49.38 
 
 
174 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  48.34 
 
 
173 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  48.34 
 
 
173 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  48.39 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  46.5 
 
 
175 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  46.5 
 
 
175 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  46.5 
 
 
175 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  47.74 
 
 
184 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  49.03 
 
 
183 aa  144  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 
165 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  45 
 
 
177 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  47.02 
 
 
178 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  46.1 
 
 
174 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  44.38 
 
 
179 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  47.06 
 
 
174 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  46.15 
 
 
167 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  44.38 
 
 
177 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  46.2 
 
 
176 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  46.21 
 
 
177 aa  141  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  47.8 
 
 
179 aa  140  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  42.07 
 
 
178 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  44.87 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  44.94 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  42.33 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  43.67 
 
 
178 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 
176 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  44.17 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  48.53 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  42.33 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  45.68 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  43.95 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  45.52 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  46.15 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  45.16 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  47.14 
 
 
170 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  45.91 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0743  inorganic diphosphatase  44.17 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0640  inorganic pyrophosphatase  44.17 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0416905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  48.15 
 
 
171 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1663  inorganic diphosphatase  43.31 
 
 
169 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  42.5 
 
 
177 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>