More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
171 aa  355  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  80.84 
 
 
167 aa  291  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  78.18 
 
 
170 aa  272  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  79.49 
 
 
168 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  77.22 
 
 
171 aa  267  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  78.85 
 
 
168 aa  266  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  76.28 
 
 
162 aa  265  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  78.85 
 
 
168 aa  264  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  74.36 
 
 
163 aa  262  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  71.51 
 
 
175 aa  259  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  76.25 
 
 
167 aa  258  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  71.01 
 
 
179 aa  257  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  74.36 
 
 
180 aa  252  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  73.72 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  72.44 
 
 
164 aa  248  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  71.79 
 
 
164 aa  246  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  71.34 
 
 
173 aa  245  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  71.15 
 
 
165 aa  244  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  71.79 
 
 
168 aa  243  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  71.15 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  66.67 
 
 
170 aa  240  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  70.51 
 
 
170 aa  239  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  67.52 
 
 
169 aa  237  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  72.22 
 
 
161 aa  233  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  62.89 
 
 
162 aa  216  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  60.51 
 
 
200 aa  205  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  61.07 
 
 
166 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  58.75 
 
 
161 aa  203  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  55.36 
 
 
170 aa  202  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  57.5 
 
 
162 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  57.5 
 
 
162 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  57.5 
 
 
162 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  57.5 
 
 
161 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  56.52 
 
 
164 aa  194  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  56.77 
 
 
164 aa  191  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  49.38 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  54.19 
 
 
175 aa  177  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  53.37 
 
 
195 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  51.92 
 
 
190 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  53.55 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  51.22 
 
 
211 aa  170  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  52.29 
 
 
169 aa  170  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  54.72 
 
 
162 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  55.35 
 
 
162 aa  168  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 
211 aa  167  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  50 
 
 
211 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  46.95 
 
 
168 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  48.45 
 
 
179 aa  159  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  52.29 
 
 
183 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  50.33 
 
 
184 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  49.67 
 
 
184 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  45.73 
 
 
171 aa  148  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  45.16 
 
 
171 aa  148  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  43.56 
 
 
178 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  46.84 
 
 
173 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  46.84 
 
 
173 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  47.74 
 
 
175 aa  147  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  47.74 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  45.57 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  45.68 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  45.45 
 
 
182 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  46.79 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  47.47 
 
 
167 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  45.75 
 
 
173 aa  143  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  47.47 
 
 
167 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  47.77 
 
 
172 aa  142  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  47.74 
 
 
175 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  45.4 
 
 
178 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  47.74 
 
 
175 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  47.74 
 
 
175 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  45.86 
 
 
179 aa  140  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  44.03 
 
 
178 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  42.41 
 
 
177 aa  140  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  42.58 
 
 
179 aa  140  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  47.85 
 
 
178 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  42.68 
 
 
178 aa  138  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  45.57 
 
 
178 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  44.03 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  45.91 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  45.91 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  47.85 
 
 
178 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  45.91 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  45.91 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  45.91 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  47.1 
 
 
176 aa  137  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  45.91 
 
 
176 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  46.45 
 
 
176 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  44.23 
 
 
176 aa  137  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  46.45 
 
 
176 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  43.31 
 
 
170 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  42.48 
 
 
177 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  44.65 
 
 
177 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>