More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0187 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  93.29 
 
 		 164 aa  317  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  65.38 
 
 		 170 aa  207  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  62.5 
 
 		 168 aa  207  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  60.38 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  59.75 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  60.65 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  59.63 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  59.63 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  61.01 
 
 		 165 aa  200  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  60.62 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  59.12 
 
 		 165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  58.49 
 
 		 170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  57.23 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  59.49 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  61.78 
 
 		 162 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  61.78 
 
 		 162 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  62.42 
 
 		 164 aa  197  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  59.38 
 
 		 162 aa  196  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  57.5 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  60.9 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  61.15 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  62.18 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  60.65 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  61.01 
 
 		 200 aa  194  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  56.33 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  59.35 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  56.77 
 
 		 171 aa  191  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  58.54 
 
 		 179 aa  190  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  56.88 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  58.71 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  59.01 
 
 		 167 aa  186  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  58.02 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  60.99 
 
 		 161 aa  184  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  58.6 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  60.14 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  56.41 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  61.36 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  59.85 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  53.85 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  46.3 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  50.62 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  51.57 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  49.09 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  49.38 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  47.4 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  43.21 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  49.4 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  44.85 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  47.83 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  47.2 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  47.2 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  47.5 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  48.72 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  48.72 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  51.59 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  49.07 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  47.47 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  44.31 
 
 		 178 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  49.69 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  49.07 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  50 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  49.68 
 
 		 179 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  47.8 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  51.28 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  51.9 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  49.4 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  51.9 
 
 		 176 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  48.72 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  44.97 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  48.77 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  47.53 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  49.68 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  48.15 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  47.24 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  47.53 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  48.47 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  50.32 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  47.53 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  45.83 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2972  inorganic diphosphatase  49.36 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5744  inorganic pyrophosphatase  49.04 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0875  inorganic pyrophosphatase  49.04 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0015  inorganic diphosphatase  50 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  48.15 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  45 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2421  inorganic pyrophosphatase  49.04 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>