More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0492 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  64.2 
 
 
175 aa  228  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  63.16 
 
 
174 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  61.85 
 
 
176 aa  222  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  64.71 
 
 
174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  62.28 
 
 
175 aa  217  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  60.12 
 
 
181 aa  215  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  60.12 
 
 
181 aa  215  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  59.15 
 
 
176 aa  214  5e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  58.38 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  59.04 
 
 
176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2281  inorganic diphosphatase  59.2 
 
 
176 aa  210  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.575051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  58.72 
 
 
175 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  58.72 
 
 
175 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  58.72 
 
 
175 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  59.88 
 
 
176 aa  208  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  59.88 
 
 
176 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  59.88 
 
 
176 aa  207  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  59.88 
 
 
176 aa  207  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  54.34 
 
 
182 aa  207  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  59.88 
 
 
176 aa  207  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  56.65 
 
 
177 aa  207  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  59.88 
 
 
176 aa  207  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  60.47 
 
 
176 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  60.47 
 
 
176 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  60.47 
 
 
176 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  60.47 
 
 
176 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  60.47 
 
 
176 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  61.45 
 
 
175 aa  207  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  59.3 
 
 
176 aa  207  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  59.3 
 
 
176 aa  207  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  59.3 
 
 
176 aa  207  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  59.3 
 
 
176 aa  207  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  58.38 
 
 
175 aa  207  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  56.65 
 
 
182 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
176 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
175 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
175 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  58.38 
 
 
177 aa  205  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  63.46 
 
 
176 aa  204  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  58.14 
 
 
175 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  58.72 
 
 
176 aa  204  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  56.65 
 
 
175 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  56.65 
 
 
178 aa  203  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  59.04 
 
 
176 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
175 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
175 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
175 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
175 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  59.04 
 
 
178 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1975  Inorganic diphosphatase  56.07 
 
 
178 aa  202  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  54.91 
 
 
206 aa  202  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  58.14 
 
 
176 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  59.88 
 
 
176 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  56.29 
 
 
172 aa  201  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  59.88 
 
 
176 aa  201  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  62.18 
 
 
176 aa  201  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  56.65 
 
 
177 aa  201  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  56.07 
 
 
175 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  55.23 
 
 
173 aa  201  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  54.49 
 
 
177 aa  201  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  57.67 
 
 
175 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  56.07 
 
 
175 aa  200  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  56.98 
 
 
177 aa  200  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  56.98 
 
 
176 aa  200  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  53.49 
 
 
177 aa  200  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5744  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
175 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590412  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  54.65 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  56.4 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2421  inorganic pyrophosphatase  53.18 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2327  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
175 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1805  inorganic pyrophosphatase  53.18 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2417  inorganic pyrophosphatase  53.18 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  58.43 
 
 
178 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  57.99 
 
 
176 aa  198  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
175 aa  198  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  58.43 
 
 
180 aa  198  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  56.02 
 
 
177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  53.18 
 
 
178 aa  197  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
178 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0875  inorganic pyrophosphatase  52.6 
 
 
175 aa  197  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2462  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
204 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0015  inorganic diphosphatase  51.52 
 
 
185 aa  197  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  53.18 
 
 
175 aa  197  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2173  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
175 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000976999 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  55.75 
 
 
178 aa  197  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  55.23 
 
 
176 aa  196  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  54.82 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  54.07 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  54.82 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0878  inorganic pyrophosphatase  53.76 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  56.02 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  55.42 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>