More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1473 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1473  inorganic diphosphatase  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2300  inorganic diphosphatase  83.52 
 
 		 179 aa  310  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1702  inorganic diphosphatase  84 
 
 		 180 aa  308  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  76.44 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  73.71 
 
 		 175 aa  281  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2972  inorganic diphosphatase  72.32 
 
 		 179 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  73.86 
 
 		 179 aa  279  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  74.86 
 
 		 178 aa  278  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  72.73 
 
 		 178 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  71.02 
 
 		 176 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  71.02 
 
 		 186 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  72 
 
 		 178 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  68.97 
 
 		 175 aa  257  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  63.64 
 
 		 206 aa  244  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  65.52 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  62.07 
 
 		 175 aa  230  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  61.71 
 
 		 175 aa  228  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  59.66 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  59.77 
 
 		 182 aa  224  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  58.86 
 
 		 178 aa  224  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  223  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  56.32 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  60.12 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  59.77 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  59.54 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  58.29 
 
 		 175 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  60.23 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2613  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 		 175 aa  217  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  57.14 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0678  inorganic pyrophosphatase  57.14 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  57.71 
 
 		 175 aa  210  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0878  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 		 175 aa  209  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  57.14 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  60.48 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  61.08 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  60.48 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0736  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1590  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3007  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2277  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0875  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1084  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1237  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1078  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2173  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000976999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5744  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 175 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1805  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 		 175 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2417  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 		 175 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2421  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 		 175 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  56.57 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  56.57 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  56.57 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1975  Inorganic diphosphatase  54.55 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2327  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 		 175 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2462  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 		 204 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  58.08 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  58.08 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  57.4 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  59.28 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  51.7 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  52.27 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02598  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  60.26 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0743  inorganic diphosphatase  55.29 
 
 		 175 aa  193  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0640  inorganic pyrophosphatase  55.29 
 
 		 175 aa  193  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0416905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  54.29 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  52.87 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  50.29 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  50.86 
 
 		 175 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  51.18 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0146  inorganic pyrophosphatase  54.97 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3318  inorganic pyrophosphatase  59.52 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  51.7 
 
 		 176 aa  191  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  50.87 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  50 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  50.57 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  49.71 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  49.71 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  48.82 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1496  inorganic diphosphatase  53.18 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  49.42 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>