More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2417 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2421  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1805  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2417  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5744  inorganic pyrophosphatase  98.86 
 
 
175 aa  358  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2462  inorganic pyrophosphatase  97.71 
 
 
204 aa  354  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2327  inorganic pyrophosphatase  97.71 
 
 
175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0875  inorganic pyrophosphatase  96.57 
 
 
175 aa  352  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2173  inorganic pyrophosphatase  92 
 
 
175 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000976999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  93.14 
 
 
175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  92.57 
 
 
175 aa  338  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0736  inorganic pyrophosphatase  91.43 
 
 
175 aa  336  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3007  inorganic pyrophosphatase  91.43 
 
 
175 aa  336  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1590  inorganic pyrophosphatase  91.43 
 
 
175 aa  336  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2277  inorganic pyrophosphatase  91.43 
 
 
175 aa  336  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1078  inorganic pyrophosphatase  90.86 
 
 
175 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1237  inorganic pyrophosphatase  90.86 
 
 
175 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1084  inorganic pyrophosphatase  90.86 
 
 
175 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0878  inorganic pyrophosphatase  90.86 
 
 
175 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0678  inorganic pyrophosphatase  80.57 
 
 
175 aa  296  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2613  inorganic pyrophosphatase  81.71 
 
 
175 aa  294  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  77.14 
 
 
175 aa  285  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  77.14 
 
 
175 aa  285  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  76.57 
 
 
175 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  64.57 
 
 
178 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  63.43 
 
 
176 aa  229  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  63.43 
 
 
186 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  59.77 
 
 
176 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  62.07 
 
 
182 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1975  Inorganic diphosphatase  62.29 
 
 
178 aa  227  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  61.49 
 
 
175 aa  225  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  61.71 
 
 
175 aa  224  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  60 
 
 
176 aa  224  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  59.2 
 
 
182 aa  224  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  59.2 
 
 
175 aa  223  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  64.67 
 
 
176 aa  222  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  64.67 
 
 
176 aa  222  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  64.67 
 
 
176 aa  222  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  64.67 
 
 
176 aa  222  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  64.67 
 
 
176 aa  222  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  60.57 
 
 
175 aa  222  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  59.43 
 
 
178 aa  221  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  64.07 
 
 
176 aa  221  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  62.29 
 
 
175 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  58.86 
 
 
206 aa  221  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  62.29 
 
 
175 aa  221  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  64.07 
 
 
176 aa  221  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  62.29 
 
 
175 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  64.07 
 
 
176 aa  221  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  64.07 
 
 
176 aa  221  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 
175 aa  221  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  59.43 
 
 
175 aa  221  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  59.2 
 
 
177 aa  220  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  58.05 
 
 
178 aa  220  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  60 
 
 
178 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2300  inorganic diphosphatase  60 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  63.25 
 
 
176 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  63.86 
 
 
176 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  63.86 
 
 
176 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  63.86 
 
 
176 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  63.86 
 
 
176 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  60 
 
 
175 aa  218  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  59.77 
 
 
176 aa  218  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  63.86 
 
 
176 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 
175 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 
175 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1702  inorganic diphosphatase  59.43 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  65.06 
 
 
176 aa  217  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  57.8 
 
 
178 aa  217  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  58.86 
 
 
176 aa  217  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  58.05 
 
 
178 aa  216  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  63.25 
 
 
176 aa  216  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2281  inorganic diphosphatase  56.57 
 
 
176 aa  215  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.575051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  57.47 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  63.86 
 
 
176 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  57.71 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2972  inorganic diphosphatase  58.29 
 
 
179 aa  214  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  65.38 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  62.28 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
175 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  57.14 
 
 
175 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  60.24 
 
 
176 aa  210  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  55.75 
 
 
175 aa  210  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  58.58 
 
 
182 aa  210  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  56.32 
 
 
175 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  56.32 
 
 
175 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  56.32 
 
 
175 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  56.32 
 
 
175 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  56.57 
 
 
182 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  56 
 
 
176 aa  208  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1496  inorganic diphosphatase  55.75 
 
 
177 aa  206  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1473  inorganic diphosphatase  56 
 
 
178 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 
177 aa  205  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  54.6 
 
 
175 aa  204  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  56.57 
 
 
179 aa  204  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
181 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  52.87 
 
 
181 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  53.18 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  53.18 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  52.3 
 
 
178 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0608  inorganic pyrophosphatase  55.11 
 
 
177 aa  192  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0773758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>