More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2664 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  94.86 
 
 
177 aa  348  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  84.75 
 
 
179 aa  324  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  84.75 
 
 
179 aa  324  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  84.83 
 
 
181 aa  322  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  80.23 
 
 
177 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  81.14 
 
 
180 aa  304  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  79.78 
 
 
178 aa  303  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  82.56 
 
 
181 aa  303  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  79.1 
 
 
178 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  81.61 
 
 
176 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  81.03 
 
 
176 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  79.66 
 
 
178 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  79.21 
 
 
178 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  74.01 
 
 
177 aa  291  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  75.14 
 
 
199 aa  290  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  75.43 
 
 
179 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  73.6 
 
 
178 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  73.3 
 
 
178 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  74.14 
 
 
177 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  72.41 
 
 
177 aa  278  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  72.41 
 
 
176 aa  276  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  71.84 
 
 
176 aa  276  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  71.84 
 
 
176 aa  276  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  61.36 
 
 
176 aa  234  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  59.43 
 
 
175 aa  231  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  59.43 
 
 
177 aa  228  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  59.2 
 
 
178 aa  224  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  52.81 
 
 
179 aa  205  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  56.47 
 
 
178 aa  205  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
175 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
175 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
175 aa  204  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0146  inorganic pyrophosphatase  55.88 
 
 
179 aa  204  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  54.24 
 
 
182 aa  203  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  55.81 
 
 
178 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  59.04 
 
 
173 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  59.04 
 
 
173 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  52.87 
 
 
175 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  52.81 
 
 
179 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  55.43 
 
 
176 aa  201  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  51.72 
 
 
175 aa  200  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  52.81 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  55.43 
 
 
176 aa  198  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 
176 aa  198  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 
176 aa  198  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 
176 aa  198  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 
176 aa  198  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 
176 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  54.86 
 
 
176 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  56.57 
 
 
176 aa  197  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 
176 aa  197  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 
176 aa  197  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  54.07 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  50.85 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  53.14 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  52.33 
 
 
182 aa  195  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  55.17 
 
 
175 aa  195  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
175 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  51.15 
 
 
175 aa  194  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  53.49 
 
 
177 aa  194  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  54.91 
 
 
176 aa  194  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  52.84 
 
 
206 aa  193  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  52.91 
 
 
175 aa  192  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  51.74 
 
 
176 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  54.76 
 
 
176 aa  190  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  50 
 
 
178 aa  189  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  56.07 
 
 
176 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  51.43 
 
 
177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  49.44 
 
 
179 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  52.33 
 
 
177 aa  187  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  50.57 
 
 
176 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  51.16 
 
 
175 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  49.71 
 
 
176 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  51.18 
 
 
175 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  50.57 
 
 
175 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  51.15 
 
 
186 aa  185  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  49.15 
 
 
178 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  51.76 
 
 
175 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  51.15 
 
 
176 aa  185  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  51.18 
 
 
181 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  51.18 
 
 
181 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  50.58 
 
 
178 aa  184  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  50.29 
 
 
174 aa  184  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  49.43 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2300  inorganic diphosphatase  49.16 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  49.71 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  50.58 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  48.31 
 
 
178 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1473  inorganic diphosphatase  48.82 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1702  inorganic diphosphatase  50 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  48.85 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02598  inorganic pyrophosphatase  51.43 
 
 
178 aa  181  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>