More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5439 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5439  Inorganic diphosphatase  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.706017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3108  inorganic pyrophosphatase  69.94 
 
 
176 aa  259  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0793  Inorganic diphosphatase  64.94 
 
 
177 aa  251  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1182  inorganic diphosphatase  64.94 
 
 
177 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1188  Inorganic diphosphatase  64.94 
 
 
189 aa  248  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0788222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1577  Inorganic diphosphatase  61.85 
 
 
177 aa  244  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1277  inorganic diphosphatase  61.93 
 
 
185 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0903  Inorganic diphosphatase  63.22 
 
 
188 aa  243  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4067  Inorganic diphosphatase  64.41 
 
 
183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.491651  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0444  inorganic pyrophosphatase  61.85 
 
 
181 aa  235  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0113658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  55.49 
 
 
178 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  50.88 
 
 
184 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  52.05 
 
 
183 aa  187  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  51.46 
 
 
206 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  51.46 
 
 
206 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  51.46 
 
 
206 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  50.29 
 
 
215 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  46.78 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  44.57 
 
 
179 aa  171  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  45.61 
 
 
184 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  44.12 
 
 
183 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2042  inorganic diphosphatase  45.2 
 
 
178 aa  167  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  42.53 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  45.86 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  43.95 
 
 
167 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  41.38 
 
 
177 aa  148  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  41.67 
 
 
178 aa  148  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  44.3 
 
 
170 aa  147  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2590  Inorganic diphosphatase  41.38 
 
 
176 aa  147  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  41.57 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  42.69 
 
 
177 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  45.06 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  45.75 
 
 
162 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  45.75 
 
 
162 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  45.75 
 
 
162 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  45.33 
 
 
169 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  41.95 
 
 
178 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3548  inorganic pyrophosphatase  42.41 
 
 
169 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  39.52 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  41.32 
 
 
211 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
173 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
173 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  40.37 
 
 
171 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 
211 aa  137  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  45.34 
 
 
172 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  44.17 
 
 
172 aa  136  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  41.04 
 
 
179 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  41.36 
 
 
211 aa  136  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  40.94 
 
 
177 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  45.03 
 
 
162 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 
171 aa  136  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  44.16 
 
 
176 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
178 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  41.67 
 
 
181 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  41.92 
 
 
176 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  43.11 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  42.77 
 
 
180 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  42.24 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  39.88 
 
 
175 aa  134  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  40.48 
 
 
179 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
177 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  40.48 
 
 
179 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  40.83 
 
 
179 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  38.95 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  40.59 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  44.79 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  38.36 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  38.36 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  39.53 
 
 
176 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  43.71 
 
 
179 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  42.95 
 
 
175 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  38.37 
 
 
176 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  39.31 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  40.48 
 
 
177 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  39.31 
 
 
175 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  42.77 
 
 
176 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  40.38 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  40.72 
 
 
177 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1361  inorganic pyrophosphatase  43.12 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.554258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  41.32 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  43.87 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  43.75 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  38.01 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  37.21 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  41.57 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  37.21 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  44.38 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  40.23 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  42.76 
 
 
168 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  40.38 
 
 
165 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
178 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  39.52 
 
 
181 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  41.32 
 
 
178 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  38.73 
 
 
175 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  40.36 
 
 
175 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  41.45 
 
 
167 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  45.14 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>