More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3373 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3373  Inorganic diphosphatase  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2049  inorganic diphosphatase  70.2 
 
 		 199 aa  281  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.863181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1233  inorganic diphosphatase  63.31 
 
 		 200 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2390  inorganic diphosphatase  52.41 
 
 		 186 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.138503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1560  Inorganic diphosphatase  57.14 
 
 		 203 aa  204  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28321  normal  0.553892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  45.14 
 
 		 175 aa  157  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  44.19 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  46.24 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0851639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  45.29 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  46.11 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  44.12 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  44.12 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  44.12 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  44.12 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  43.6 
 
 		 182 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  43.75 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  43.86 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  43.18 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  42.61 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  42.61 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  42.61 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  42.61 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  42.61 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  42.94 
 
 		 175 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  45.96 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0608  inorganic pyrophosphatase  46.91 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0773758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  41.21 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  43.1 
 
 		 177 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  41.52 
 
 		 177 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  45.22 
 
 		 176 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  42.86 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  44.71 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  42.26 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  47.02 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  44.3 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  44.31 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  43.83 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  44.71 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0015  inorganic diphosphatase  40.96 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  41.86 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  40.99 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  41.76 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  40.12 
 
 		 174 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1978  inorganic diphosphatase  43.45 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  41.67 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  42.86 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  47.1 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  41.07 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  42.94 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  43.2 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0470  inorganic diphosphatase  43.71 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0790393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  43.71 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  43.71 
 
 		 176 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  40.96 
 
 		 177 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  37.87 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2281  inorganic diphosphatase  38.37 
 
 		 176 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.575051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0741  inorganic pyrophosphatase  42.33 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1361  inorganic pyrophosphatase  42.33 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.554258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  37.89 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0666  inorganic pyrophosphatase  42.33 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.127222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  41.98 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  40.91 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  41.25 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  42.5 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0736  inorganic pyrophosphatase  39.53 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  37.85 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3007  inorganic pyrophosphatase  39.53 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0878  inorganic pyrophosphatase  40.12 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  41.25 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2421  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  41.21 
 
 		 178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  39.75 
 
 		 178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1805  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2417  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1590  inorganic pyrophosphatase  39.53 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2277  inorganic pyrophosphatase  39.53 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  42.14 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  41.21 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  43.67 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2462  inorganic pyrophosphatase  38.33 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  41.71 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2327  inorganic pyrophosphatase  40 
 
 		 175 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  37.64 
 
 		 178 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0734  inorganic pyrophosphatase  43.48 
 
 		 172 aa  129  4.0000000000000003e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0875  inorganic pyrophosphatase  39.41 
 
 		 175 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.639124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>