More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1560 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1560  Inorganic diphosphatase  100 
 
 
203 aa  411  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28321  normal  0.553892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1233  inorganic diphosphatase  59.64 
 
 
200 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3373  Inorganic diphosphatase  52.06 
 
 
203 aa  205  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2049  inorganic diphosphatase  50.78 
 
 
199 aa  201  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.863181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2390  inorganic diphosphatase  53.59 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.138503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  46.39 
 
 
171 aa  151  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  46.78 
 
 
177 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  48.17 
 
 
178 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0734  inorganic pyrophosphatase  45.29 
 
 
172 aa  149  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  46.06 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  43.27 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  48.45 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  46.01 
 
 
172 aa  145  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  46.34 
 
 
199 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  44.91 
 
 
176 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  45.78 
 
 
174 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
175 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  44.91 
 
 
175 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  44.91 
 
 
175 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  44.58 
 
 
175 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  44.19 
 
 
178 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  43.98 
 
 
175 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
175 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  46.58 
 
 
173 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  46.58 
 
 
173 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  44.91 
 
 
175 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  42.11 
 
 
178 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  44.91 
 
 
175 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  43.83 
 
 
179 aa  141  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  42.11 
 
 
178 aa  140  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  43.56 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  44.58 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02598  inorganic pyrophosphatase  46.47 
 
 
178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  43.71 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  43.6 
 
 
178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  45.96 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  43.71 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  43.71 
 
 
176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  43.71 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  47.2 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  44.91 
 
 
176 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  42.11 
 
 
182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3318  inorganic pyrophosphatase  48.52 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  43.27 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  45.51 
 
 
175 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 
176 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  43.9 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  44.51 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  43.37 
 
 
176 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  45.73 
 
 
177 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  42.17 
 
 
177 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  45.12 
 
 
181 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  45.18 
 
 
178 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  41.92 
 
 
177 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  42.11 
 
 
175 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  44.72 
 
 
179 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  44.51 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  44.51 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  134  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  42.51 
 
 
176 aa  134  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
176 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  43.29 
 
 
176 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  43.9 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  43.29 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  43.9 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  43.9 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  41.18 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  44.05 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  44.58 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  43.9 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  43.29 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  43.86 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1496  inorganic diphosphatase  42.77 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  44.1 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  43.71 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  43.11 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  42.11 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  42.69 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  42.77 
 
 
178 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2281  inorganic diphosphatase  44.64 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.575051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0678  inorganic pyrophosphatase  43.02 
 
 
175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  42.07 
 
 
172 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  43.27 
 
 
175 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  41.92 
 
 
178 aa  131  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  46.01 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  45.12 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  41.67 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  42.33 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>