More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5121 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5121  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.551351  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2409  Inorganic diphosphatase  68.48 
 
 
200 aa  270  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0153  inorganic pyrophosphatase  53.23 
 
 
209 aa  204  6e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1134  inorganic pyrophosphatase  49.45 
 
 
204 aa  187  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0610778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3432  inorganic pyrophosphatase  49.19 
 
 
205 aa  188  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4422  Inorganic diphosphatase  44.83 
 
 
220 aa  180  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0026562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5439  Inorganic diphosphatase  40.32 
 
 
181 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.706017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4067  Inorganic diphosphatase  41.4 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.491651  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3108  inorganic pyrophosphatase  37.43 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  34.22 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0444  inorganic pyrophosphatase  36.65 
 
 
181 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0113658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  37.71 
 
 
206 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  36.72 
 
 
215 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  37.71 
 
 
206 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  37.71 
 
 
206 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1577  Inorganic diphosphatase  34.76 
 
 
177 aa  101  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821262  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  33.88 
 
 
183 aa  100  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1188  Inorganic diphosphatase  35.45 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0788222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1277  inorganic diphosphatase  35.29 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1182  inorganic diphosphatase  36.32 
 
 
177 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  37.58 
 
 
184 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0793  Inorganic diphosphatase  35.83 
 
 
177 aa  98.6  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  36.31 
 
 
184 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0903  Inorganic diphosphatase  34.92 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  32.97 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  31.32 
 
 
183 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  32.97 
 
 
179 aa  91.7  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  34.95 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1560  Inorganic diphosphatase  31.69 
 
 
203 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28321  normal  0.553892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2049  inorganic diphosphatase  31.87 
 
 
199 aa  87.8  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.863181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  31.98 
 
 
162 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1233  inorganic diphosphatase  34.08 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  31.72 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  32.24 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  33.15 
 
 
174 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  31.4 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  31.4 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  33.16 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  35.45 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  31.55 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  31.55 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  31.55 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  32.79 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  31.87 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  32 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  30.65 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2590  Inorganic diphosphatase  30.11 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  31.91 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  33.16 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  32.98 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2042  inorganic diphosphatase  33.99 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  31.91 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  31.35 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  31.35 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  33.33 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  30.05 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3373  Inorganic diphosphatase  30.43 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  33.13 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  34.34 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  30.77 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  33.13 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  33.13 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  34.13 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  33.16 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  33.13 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  30.48 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02598  inorganic pyrophosphatase  31.94 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  33.51 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2390  inorganic diphosphatase  33.7 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.138503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  31.91 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  30.48 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2613  inorganic pyrophosphatase  32.62 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  31.87 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  30.05 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  32.05 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  33.52 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05211  putative inorganic pyrophosphatase  33.51 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  31.38 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1083  inorganic diphosphatase  31.55 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  30.64 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0470  inorganic diphosphatase  31.15 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0790393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05511  putative inorganic pyrophosphatase  33.51 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0629399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05581  putative inorganic pyrophosphatase  34.46 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  33.86 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  31.55 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  31.38 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  30.16 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0819  inorganic diphosphatase  31.32 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00529828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  32.53 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  31.18 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  29.9 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  30.32 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  33.73 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  30.37 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  31.38 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1978  inorganic diphosphatase  30.94 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0678  inorganic pyrophosphatase  32.09 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  30.77 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  32.18 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  31.91 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>