More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2577 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2812  ATPase AAA-2 domain protein  82.95 
 
 
440 aa  752    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  79.68 
 
 
441 aa  715    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1973  ATPase  80.32 
 
 
439 aa  719    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2413  ATPase AAA-2 domain protein  84.67 
 
 
442 aa  758    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2439  ATPase AAA-2 domain protein  78.49 
 
 
440 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2170  ATPase AAA-2 domain protein  78.62 
 
 
440 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2577  ATPase  100 
 
 
440 aa  886    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  59.95 
 
 
863 aa  533  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  57.98 
 
 
864 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  57.94 
 
 
863 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  59.95 
 
 
880 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  60.19 
 
 
867 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0495  ATP-dependent chaperone ClpB  59.29 
 
 
873 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  59.57 
 
 
867 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  58.96 
 
 
868 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  57.41 
 
 
893 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  54.36 
 
 
872 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  57.41 
 
 
865 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  57.68 
 
 
871 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  56.34 
 
 
863 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  52.06 
 
 
872 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  56 
 
 
862 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  50.93 
 
 
872 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  54.92 
 
 
871 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  53.66 
 
 
883 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  58.27 
 
 
867 aa  489  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  51.39 
 
 
870 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  52.18 
 
 
876 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  54.69 
 
 
871 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  53.9 
 
 
872 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  53.9 
 
 
872 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  57.18 
 
 
871 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  53.56 
 
 
873 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  52.57 
 
 
861 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  53.55 
 
 
870 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  53.32 
 
 
870 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  53.55 
 
 
870 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  52.49 
 
 
879 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  52.19 
 
 
854 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  51.05 
 
 
862 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  53.15 
 
 
866 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  50.58 
 
 
879 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  52.48 
 
 
861 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  50.46 
 
 
894 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  50.93 
 
 
865 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  50.93 
 
 
865 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0578  ATP-dependent chaperone ClpB  52.07 
 
 
868 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  50.8 
 
 
899 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  50.7 
 
 
865 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  50.7 
 
 
865 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  52.18 
 
 
893 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  50.7 
 
 
865 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.47 
 
 
863 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  50.35 
 
 
879 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  51.4 
 
 
859 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2717  ATP-dependent chaperone ClpB  54.21 
 
 
859 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.901861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0815  ClpB protein  51.38 
 
 
859 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  50.7 
 
 
865 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  50.23 
 
 
865 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  48.84 
 
 
862 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  51.68 
 
 
855 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  49.65 
 
 
876 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  50.35 
 
 
879 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  51.06 
 
 
878 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  50.8 
 
 
862 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  53.21 
 
 
878 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  51.26 
 
 
859 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  50.7 
 
 
865 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  51.42 
 
 
870 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  51.72 
 
 
864 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  50.46 
 
 
863 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  51.52 
 
 
873 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  50.11 
 
 
891 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2848  protein disaggregation chaperone  50.71 
 
 
857 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000767597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  52.08 
 
 
890 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 
865 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  50 
 
 
879 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  50.93 
 
 
870 aa  455  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  50.93 
 
 
865 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  51.85 
 
 
865 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1004  protein disaggregation chaperone  51.18 
 
 
857 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4216  ATPase AAA-2 domain protein  49.65 
 
 
878 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0815714  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1249  ATPase  50.59 
 
 
869 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.748877  decreased coverage  0.00497256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  51.65 
 
 
862 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  50 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  49.42 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  50 
 
 
869 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6943  ATP-dependent chaperone ClpB  50.82 
 
 
860 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2223  ATPase AAA-2  50 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  50.92 
 
 
861 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1138  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2261  clpB protein  49.77 
 
 
865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342384  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 
865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  50.23 
 
 
865 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  51.53 
 
 
875 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  52.25 
 
 
864 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000672053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  49.08 
 
 
864 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0567  ATP-dependent chaperone ClpB  50.35 
 
 
862 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0522418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>