More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1973 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2812  ATPase AAA-2 domain protein  82.38 
 
 		 440 aa  742    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2439  ATPase AAA-2 domain protein  77.45 
 
 		 440 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  80.5 
 
 		 441 aa  719    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1973  ATPase  100 
 
 		 439 aa  885    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2170  ATPase AAA-2 domain protein  78.39 
 
 		 440 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2577  ATPase  80.32 
 
 		 440 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2413  ATPase AAA-2 domain protein  80.64 
 
 		 442 aa  730    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  58.88 
 
 		 863 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  57.47 
 
 		 864 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0495  ATP-dependent chaperone ClpB  60.99 
 
 		 873 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  60.28 
 
 		 880 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  61.06 
 
 		 867 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  58.55 
 
 		 868 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  57.01 
 
 		 865 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  58.06 
 
 		 863 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  56.75 
 
 		 893 aa  513  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  56.28 
 
 		 871 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  57.88 
 
 		 867 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  52.52 
 
 		 872 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  59.62 
 
 		 871 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  54.55 
 
 		 863 aa  491  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  56.5 
 
 		 867 aa  488  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  53.18 
 
 		 862 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  54.27 
 
 		 861 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  52.07 
 
 		 883 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  53.61 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  55.04 
 
 		 871 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  52.94 
 
 		 854 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  50.93 
 
 		 872 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  54.8 
 
 		 871 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  52.05 
 
 		 879 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  52.59 
 
 		 855 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  48.84 
 
 		 872 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  51.44 
 
 		 873 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  49.54 
 
 		 862 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  51.16 
 
 		 872 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  51.16 
 
 		 872 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  51.85 
 
 		 878 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  53.13 
 
 		 875 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  53.15 
 
 		 866 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  51.66 
 
 		 876 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  48.75 
 
 		 870 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2717  ATP-dependent chaperone ClpB  53.25 
 
 		 859 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.901861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  51.16 
 
 		 878 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  49.53 
 
 		 876 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1004  protein disaggregation chaperone  51.74 
 
 		 857 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  51.76 
 
 		 879 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  51.5 
 
 		 879 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  52.11 
 
 		 870 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  52.35 
 
 		 874 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  50.91 
 
 		 865 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.96 
 
 		 874 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  49.31 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  51.15 
 
 		 870 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  51.66 
 
 		 870 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  51.05 
 
 		 879 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  52.8 
 
 		 859 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  51.4 
 
 		 878 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4216  ATPase AAA-2 domain protein  52.47 
 
 		 878 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0815714  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  51.41 
 
 		 893 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  51.52 
 
 		 889 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  51.96 
 
 		 931 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  51.42 
 
 		 870 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  50.23 
 
 		 871 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  51.87 
 
 		 873 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  51.52 
 
 		 891 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  50.82 
 
 		 879 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  51.64 
 
 		 874 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  52.35 
 
 		 874 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  49.31 
 
 		 871 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  51.64 
 
 		 862 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3141  protein disaggregation chaperone  51.04 
 
 		 857 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0416591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  51.96 
 
 		 878 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  51.64 
 
 		 874 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3479  ATP-dependent chaperone ClpB  52.46 
 
 		 880 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0578  ATP-dependent chaperone ClpB  51.65 
 
 		 868 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2848  protein disaggregation chaperone  51.75 
 
 		 857 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000767597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  52.11 
 
 		 874 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  50 
 
 		 859 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  50.46 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2499  ATPase  51.26 
 
 		 868 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12530  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.3 
 
 		 881 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0853333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  50.93 
 
 		 860 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  51.28 
 
 		 854 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  51.16 
 
 		 860 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  47.36 
 
 		 862 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  54.76 
 
 		 866 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  51.64 
 
 		 870 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2815  ATPase  50.35 
 
 		 870 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565756  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1249  ATPase  52.3 
 
 		 869 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.748877  decreased coverage  0.00497256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  54.37 
 
 		 891 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0246  ATPase  50.23 
 
 		 848 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  50.35 
 
 		 864 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 		 873 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  50.69 
 
 		 861 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.08 
 
 		 859 aa  444  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  48.5 
 
 		 889 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  51.98 
 
 		 866 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  50.46 
 
 		 865 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  50.83 
 
 		 860 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>