More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2812 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2413  ATPase AAA-2 domain protein  82.92 
 
 		 442 aa  754    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  80 
 
 		 441 aa  711    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1973  ATPase  82.38 
 
 		 439 aa  742    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2170  ATPase AAA-2 domain protein  77.63 
 
 		 440 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2812  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 		 440 aa  885    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2439  ATPase AAA-2 domain protein  77.63 
 
 		 440 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2577  ATPase  82.95 
 
 		 440 aa  752    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  58.41 
 
 		 865 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0495  ATP-dependent chaperone ClpB  59.35 
 
 		 873 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  56.71 
 
 		 863 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  57.89 
 
 		 880 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  58.53 
 
 		 867 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  56.74 
 
 		 863 aa  512  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  55.09 
 
 		 864 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  57.61 
 
 		 871 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  54.17 
 
 		 872 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  58.19 
 
 		 867 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  55.97 
 
 		 893 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  56.8 
 
 		 868 aa  498  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  54.13 
 
 		 871 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  54.13 
 
 		 871 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  55.08 
 
 		 863 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  51.03 
 
 		 872 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  54.11 
 
 		 867 aa  484  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  50.11 
 
 		 872 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  54.29 
 
 		 862 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  56.68 
 
 		 871 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  50.57 
 
 		 870 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  52.76 
 
 		 870 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  51.5 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  52.76 
 
 		 870 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  51.61 
 
 		 883 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  52.76 
 
 		 870 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  53.95 
 
 		 859 aa  472  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  50.81 
 
 		 876 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  52.41 
 
 		 893 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  52 
 
 		 854 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  51.39 
 
 		 872 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  48.85 
 
 		 862 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  50.12 
 
 		 862 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  51.39 
 
 		 872 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  51.4 
 
 		 879 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  51.2 
 
 		 873 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  51.16 
 
 		 879 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  53.36 
 
 		 866 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  51.8 
 
 		 855 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  49.43 
 
 		 863 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  48.85 
 
 		 894 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  50.23 
 
 		 879 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  52.63 
 
 		 878 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  49.3 
 
 		 873 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  51.04 
 
 		 863 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  49.43 
 
 		 879 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  51.29 
 
 		 875 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  49.77 
 
 		 879 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  50.47 
 
 		 862 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  50.46 
 
 		 865 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6943  ATP-dependent chaperone ClpB  50.94 
 
 		 860 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  50.35 
 
 		 861 aa  451  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  49.43 
 
 		 865 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  48.37 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4216  ATPase AAA-2 domain protein  49.07 
 
 		 878 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0815714  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  50 
 
 		 848 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2717  ATP-dependent chaperone ClpB  52.48 
 
 		 859 aa  448  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.901861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  49.07 
 
 		 874 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  48.74 
 
 		 846 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  50.57 
 
 		 890 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  49.2 
 
 		 865 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 		 864 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000672053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0246  ATPase  49.54 
 
 		 848 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  49.54 
 
 		 859 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10389  endopeptidase ATP binding protein subunit B clpB  49.76 
 
 		 848 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000533203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  50.69 
 
 		 864 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  50.46 
 
 		 889 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  52.23 
 
 		 862 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  51.16 
 
 		 865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18660  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.27 
 
 		 864 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0343027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  48.6 
 
 		 878 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  49.3 
 
 		 875 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  49.54 
 
 		 876 aa  441  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  48.97 
 
 		 865 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  47.58 
 
 		 889 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  48.85 
 
 		 891 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  51.03 
 
 		 872 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  49.08 
 
 		 865 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0578  ATP-dependent chaperone ClpB  49.66 
 
 		 868 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  47.38 
 
 		 864 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  49.07 
 
 		 848 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  49.77 
 
 		 861 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  49.08 
 
 		 865 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  50.46 
 
 		 860 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  48.61 
 
 		 878 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  48.85 
 
 		 862 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  48.62 
 
 		 865 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  49.07 
 
 		 848 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  49.08 
 
 		 865 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  48.62 
 
 		 865 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  49.07 
 
 		 848 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  48.38 
 
 		 865 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0009  ATP-dependent chaperone ClpB  50.23 
 
 		 888 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>