More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2439 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2170  ATPase AAA-2 domain protein  84.09 
 
 		 440 aa  759    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  78.64 
 
 		 441 aa  712    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1973  ATPase  77.45 
 
 		 439 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2439  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 		 440 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2812  ATPase AAA-2 domain protein  77.63 
 
 		 440 aa  707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2413  ATPase AAA-2 domain protein  79.27 
 
 		 442 aa  718    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2577  ATPase  78.49 
 
 		 440 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0495  ATP-dependent chaperone ClpB  61.78 
 
 		 873 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  57.85 
 
 		 863 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  59.95 
 
 		 867 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  56.28 
 
 		 865 aa  511  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  59.76 
 
 		 880 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  56.78 
 
 		 863 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  57.59 
 
 		 864 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  58.56 
 
 		 868 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  57.82 
 
 		 867 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  55.79 
 
 		 871 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  56.69 
 
 		 863 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  52.53 
 
 		 872 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  58.37 
 
 		 871 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  51.62 
 
 		 872 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  52.07 
 
 		 870 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  55.12 
 
 		 893 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  56.9 
 
 		 867 aa  478  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  51.95 
 
 		 872 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  52.18 
 
 		 883 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  51.95 
 
 		 872 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  52.9 
 
 		 873 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  52.08 
 
 		 879 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  53.02 
 
 		 879 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  54.35 
 
 		 862 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  50.8 
 
 		 876 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  53.13 
 
 		 879 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  51.84 
 
 		 879 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  51.86 
 
 		 879 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  53.02 
 
 		 859 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  53.54 
 
 		 871 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  53.08 
 
 		 861 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  51.16 
 
 		 854 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  51.84 
 
 		 878 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  52.67 
 
 		 861 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  49.07 
 
 		 872 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  54.01 
 
 		 871 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  52.47 
 
 		 874 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  50.58 
 
 		 876 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  51.84 
 
 		 891 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  51.53 
 
 		 874 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  52.49 
 
 		 893 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  50.23 
 
 		 878 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  51.53 
 
 		 874 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  51.54 
 
 		 870 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  51.54 
 
 		 870 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  52.26 
 
 		 870 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  51.89 
 
 		 874 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  49.89 
 
 		 863 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.4 
 
 		 874 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  49.89 
 
 		 862 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  50.11 
 
 		 879 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  52.14 
 
 		 846 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  49.88 
 
 		 855 aa  455  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  51.04 
 
 		 860 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  51.17 
 
 		 875 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  51.54 
 
 		 865 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  51.53 
 
 		 874 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  48.39 
 
 		 862 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0578  ATP-dependent chaperone ClpB  50.93 
 
 		 868 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  50.71 
 
 		 878 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4216  ATPase AAA-2 domain protein  50.57 
 
 		 878 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0815714  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  51.4 
 
 		 931 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  50.34 
 
 		 864 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  48.85 
 
 		 858 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  48.85 
 
 		 858 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  52.02 
 
 		 866 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  50.59 
 
 		 873 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  52.89 
 
 		 878 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  50.47 
 
 		 868 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  51.06 
 
 		 889 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  50.93 
 
 		 873 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.28 
 
 		 875 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  49.88 
 
 		 894 aa  448  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  51.06 
 
 		 862 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  50.12 
 
 		 871 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  49.54 
 
 		 863 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1004  protein disaggregation chaperone  49.88 
 
 		 857 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6943  ATP-dependent chaperone ClpB  51.06 
 
 		 860 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 		 867 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2717  ATP-dependent chaperone ClpB  53.48 
 
 		 859 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.901861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  51.16 
 
 		 865 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  50.46 
 
 		 889 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  52.51 
 
 		 866 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  50.59 
 
 		 880 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  51.04 
 
 		 848 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  52.51 
 
 		 866 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  50.81 
 
 		 860 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2499  ATPase  50.34 
 
 		 868 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  49.29 
 
 		 865 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  49.77 
 
 		 870 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  50 
 
 		 860 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2848  protein disaggregation chaperone  50.12 
 
 		 857 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000767597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  51.04 
 
 		 848 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>