More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1150 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.47 
 
 
411 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
402 aa  830    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.92 
 
 
407 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  41.19 
 
 
365 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.92 
 
 
374 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.9 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  39.14 
 
 
374 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.03 
 
 
399 aa  243  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  38.52 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  36.98 
 
 
360 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.68 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.42 
 
 
376 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  32.92 
 
 
370 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.58 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.44 
 
 
372 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.62 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  33.59 
 
 
377 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.13 
 
 
364 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2060  NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.19 
 
 
343 aa  188  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.9 
 
 
353 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.6 
 
 
416 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.42 
 
 
435 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
654 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4644  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.16 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.57 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2997  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.54 
 
 
423 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  31.78 
 
 
650 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.73 
 
 
423 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  32.53 
 
 
411 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1799  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.77 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  32.8 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.35 
 
 
644 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.67 
 
 
423 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.93 
 
 
427 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.92 
 
 
410 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.79 
 
 
711 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.2 
 
 
392 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.48 
 
 
441 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.45 
 
 
454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01164  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.49 
 
 
680 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.45 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.45 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.45 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.45 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.45 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.31 
 
 
646 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.34 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
668 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  29.16 
 
 
401 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1575  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.85 
 
 
433 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.65 
 
 
418 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.79 
 
 
421 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  28.57 
 
 
409 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3221  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.93 
 
 
411 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.07 
 
 
418 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
414 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
414 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.79 
 
 
411 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3485  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.95 
 
 
391 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.353269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.45 
 
 
387 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.18035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2474  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
335 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.448205  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1371  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.84 
 
 
682 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0728118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.32 
 
 
680 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.18 
 
 
706 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.566036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.4 
 
 
411 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00439084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.88 
 
 
411 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3290  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.89 
 
 
413 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.88 
 
 
411 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.16 
 
 
635 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.691445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.93 
 
 
682 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.55 
 
 
661 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  31.96 
 
 
637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2951  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.35 
 
 
677 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3375  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.61 
 
 
672 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5536  putative NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.05 
 
 
391 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.05 
 
 
680 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.79 
 
 
680 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.38 
 
 
678 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0503962  normal  0.110792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3717  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.05 
 
 
674 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2441  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.29 
 
 
412 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.71 
 
 
421 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.69 
 
 
967 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4395  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.17 
 
 
672 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  30.54 
 
 
424 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.96 
 
 
425 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02950  2,4-dienoyl-CoA reductase, NADH and FMN-linked  29.17 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0620  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.17 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.53 
 
 
680 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.67 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02900  hypothetical protein  29.17 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3548  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.17 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3517  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.09 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0619  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.17 
 
 
672 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3687  2,4-dienoyl-CoA reductase  30.81 
 
 
679 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1799  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.46 
 
 
681 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.921787  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.43 
 
 
329 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.13 
 
 
399 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.91 
 
 
650 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3263  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.09 
 
 
672 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>