More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1496 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
399 aa  828    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  37.2 
 
 
365 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.89 
 
 
374 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.64 
 
 
407 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  39.37 
 
 
360 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.84 
 
 
411 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.94 
 
 
368 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.6 
 
 
374 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.79 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  36.87 
 
 
365 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  38.95 
 
 
377 aa  242  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.84 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.97 
 
 
372 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.03 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.58 
 
 
366 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.11 
 
 
364 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  36.13 
 
 
370 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.32 
 
 
386 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.08 
 
 
654 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4644  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.65 
 
 
481 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2997  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.77 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.98 
 
 
408 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0280  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.98 
 
 
408 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.98 
 
 
408 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.86 
 
 
414 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.98 
 
 
353 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1799  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.18 
 
 
441 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3485  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.02 
 
 
391 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.353269  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.23 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.34 
 
 
441 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.76 
 
 
644 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2474  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.28 
 
 
335 aa  186  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.448205  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.5 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4880  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.58 
 
 
410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.019423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.58 
 
 
402 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.87 
 
 
937 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  34.25 
 
 
454 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  34.25 
 
 
441 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  34.25 
 
 
441 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  29.87 
 
 
637 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  31.59 
 
 
650 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  40.08 
 
 
340 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.3 
 
 
411 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00439084  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.94 
 
 
412 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.34 
 
 
711 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.98 
 
 
441 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.98 
 
 
454 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.55 
 
 
423 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.98 
 
 
441 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.09 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.33 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.71 
 
 
646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  31.56 
 
 
401 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.28 
 
 
423 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  33.99 
 
 
340 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13395  oxidoreductase  31.35 
 
 
396 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0729284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1575  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.32 
 
 
433 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.32 
 
 
401 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0188144  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.32 
 
 
401 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.7 
 
 
421 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.57 
 
 
387 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.18035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4553  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.69 
 
 
409 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  32.8 
 
 
424 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  31.12 
 
 
345 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.19 
 
 
414 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  30.4 
 
 
685 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.62 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.19 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5536  putative NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.34 
 
 
391 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  36.96 
 
 
345 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3742  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.82 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.93 
 
 
414 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.69 
 
 
646 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.44 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.19 
 
 
671 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  37.35 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.5 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2060  NADH-dependent flavin oxidoreductase  28.31 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.5 
 
 
411 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  30.75 
 
 
363 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  30.3 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.4 
 
 
652 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  37.4 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  37.01 
 
 
345 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1230  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.01 
 
 
405 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0355835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.3 
 
 
418 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_003296  RS02984  putative NADH oxidase-related oxidoreductase protein  30.67 
 
 
411 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.476298  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0681  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.41 
 
 
453 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393525  normal  0.0678316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  36.58 
 
 
345 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  36.58 
 
 
345 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.03 
 
 
418 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  36.58 
 
 
345 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.83 
 
 
662 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.5 
 
 
706 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.566036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.89 
 
 
667 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1093  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.97 
 
 
673 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.97 
 
 
673 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.12 
 
 
427 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.38 
 
 
397 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>