More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1700 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02984  putative NADH oxidase-related oxidoreductase protein  85.93 
 
 
411 aa  705    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.476298  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
411 aa  831    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.85 
 
 
414 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  84.91 
 
 
411 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  84.88 
 
 
414 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.54 
 
 
411 aa  821    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  85.82 
 
 
420 aa  727    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.85 
 
 
414 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.85 
 
 
418 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  73.87 
 
 
411 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  71.22 
 
 
424 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.71 
 
 
412 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.79 
 
 
418 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3221  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.12 
 
 
411 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  72.11 
 
 
411 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.53 
 
 
411 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2441  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.86 
 
 
412 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.16 
 
 
425 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  53.91 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2215  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.25 
 
 
407 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.74 
 
 
416 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.8 
 
 
421 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
414 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.39 
 
 
441 aa  342  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.63 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.07 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.07 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.82 
 
 
454 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.82 
 
 
454 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.82 
 
 
441 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.57 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.71 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  40.51 
 
 
401 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.84 
 
 
421 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.89 
 
 
427 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0580  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.33 
 
 
408 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.63 
 
 
397 aa  255  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  38.3 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06167  FMN binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08260)  39.22 
 
 
369 aa  219  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  0.461703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.23 
 
 
372 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.39 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  33.43 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  37.57 
 
 
377 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  37.2 
 
 
374 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  32.77 
 
 
365 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.76 
 
 
374 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  34.14 
 
 
365 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.68 
 
 
368 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.16 
 
 
386 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  31.38 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  31.67 
 
 
376 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.5 
 
 
364 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.91 
 
 
366 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  32.84 
 
 
650 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  31.28 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.06 
 
 
330 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.55 
 
 
387 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.5 
 
 
399 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.29 
 
 
335 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.65 
 
 
407 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.58 
 
 
353 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.56 
 
 
646 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.66 
 
 
357 aa  160  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1595  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.14 
 
 
667 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30 
 
 
329 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.88 
 
 
402 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0121  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.05 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.2 
 
 
377 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.19 
 
 
344 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.06 
 
 
662 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.72 
 
 
646 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.6 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.75 
 
 
644 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.08 
 
 
355 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.22 
 
 
340 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.1 
 
 
356 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  32.85 
 
 
368 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  32.56 
 
 
368 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.05 
 
 
368 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03800  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 
450 aa  149  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.77 
 
 
665 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.53 
 
 
671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.24 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.66 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.82 
 
 
937 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  31.65 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  31.23 
 
 
340 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  32.17 
 
 
354 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.13 
 
 
354 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.24 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3740  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.6 
 
 
711 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.34 
 
 
711 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  35.17 
 
 
359 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.95 
 
 
368 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.08 
 
 
647 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0007  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.83 
 
 
368 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0533  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.76 
 
 
333 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30 
 
 
411 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.85 
 
 
355 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>