More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3405 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
411 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02984  putative NADH oxidase-related oxidoreductase protein  83.17 
 
 
411 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.476298  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  92.68 
 
 
414 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  84.91 
 
 
411 aa  706    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  84.43 
 
 
411 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  85.54 
 
 
420 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.39 
 
 
414 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.15 
 
 
414 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.85 
 
 
418 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  74.37 
 
 
411 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  70.98 
 
 
424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  74.12 
 
 
411 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.85 
 
 
418 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.22 
 
 
412 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3221  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.86 
 
 
411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.83 
 
 
411 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2441  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.5 
 
 
412 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.05 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  54.69 
 
 
389 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2215  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.13 
 
 
407 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
416 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.7 
 
 
423 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.14 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.33 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.33 
 
 
441 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.33 
 
 
441 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.47 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.61 
 
 
454 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.61 
 
 
441 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.64 
 
 
421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.83 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  39.75 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.05 
 
 
427 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.26 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0580  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  36.75 
 
 
399 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.86 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06167  FMN binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08260)  39.16 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  0.461703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.74 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  33.24 
 
 
360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  39.53 
 
 
374 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.79 
 
 
374 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.61 
 
 
372 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  32.46 
 
 
370 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  36.05 
 
 
377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  31.96 
 
 
376 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  33.73 
 
 
365 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.89 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.09 
 
 
364 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.11 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  32.38 
 
 
365 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.5 
 
 
330 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.12 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  33.05 
 
 
650 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.71 
 
 
387 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.42 
 
 
662 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.85 
 
 
407 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  29.81 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.44 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.81 
 
 
646 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.79 
 
 
402 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.31 
 
 
645 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1595  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
667 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.61 
 
 
329 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.56 
 
 
335 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03800  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
450 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.14 
 
 
353 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.06 
 
 
357 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.08 
 
 
411 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.75 
 
 
355 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.4 
 
 
356 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
334 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.62 
 
 
671 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  33.63 
 
 
340 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  32.43 
 
 
340 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.82 
 
 
340 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  34.01 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.78 
 
 
344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  34.15 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.24 
 
 
365 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.36 
 
 
377 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0121  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.45 
 
 
367 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  33.14 
 
 
368 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.82 
 
 
423 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.9 
 
 
646 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3290  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.6 
 
 
413 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3776  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.84 
 
 
352 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30 
 
 
654 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.55 
 
 
369 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1933  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.66 
 
 
375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  33.24 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  32.84 
 
 
681 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.09 
 
 
357 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.14 
 
 
365 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  30.97 
 
 
685 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.22 
 
 
668 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  31.9 
 
 
648 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2997  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.23 
 
 
423 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3719  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.55 
 
 
354 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>