233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0419 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0419  conserved hypothetical protein (DUF143 domain protein)  100 
 
 
109 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.825517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1250  putative nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  71.7 
 
 
291 aa  157  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000986216  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1739  hypothetical protein  69.52 
 
 
108 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1404  hypothetical protein  68.57 
 
 
108 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1592  hypothetical protein  67.62 
 
 
108 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1431  putative iojap-like protein  67.62 
 
 
105 aa  149  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0518  gerC2 protein  62.39 
 
 
293 aa  142  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.312477  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0420  nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  60.38 
 
 
293 aa  135  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0776  putative nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  60.38 
 
 
295 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000065047  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1756  Iojap-related protein  48.08 
 
 
111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  35.96 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  34.83 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0798  iojap-like protein  30.3 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.411993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  32.98 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  36.56 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  31.25 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  36.56 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  34 
 
 
122 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  28.72 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  30.39 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  35.11 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  29.81 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  29.13 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  32.98 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  31.96 
 
 
119 aa  57.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  31.91 
 
 
130 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  27.03 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  30.43 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  27.1 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  29.9 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  27.1 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  28.28 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  30.93 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1761  iojap-like protein  26.73 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  33.7 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  28.28 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  27.72 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  28.71 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  32.97 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  28.87 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  27.18 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  31.18 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  29 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  32.26 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  31.31 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1140  iojap-like protein  28.12 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000105704  normal  0.940401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  31.91 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  27.96 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  27.96 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  27.96 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  30.3 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  29.25 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  26 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  29 
 
 
128 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  31.25 
 
 
226 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  26 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  30.43 
 
 
130 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  28 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  31.91 
 
 
108 aa  52  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  28.09 
 
 
142 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  27.66 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  29.03 
 
 
164 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  28.72 
 
 
150 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  27.66 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  29.03 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  28.87 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  31.25 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  27.55 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  26.67 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  28.28 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  28.72 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  28.72 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  29 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1086  iojap-like protein  26.42 
 
 
101 aa  50.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  28.85 
 
 
137 aa  50.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  26.6 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>