More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1140 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1140  iojap-like protein  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000105704  normal  0.940401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1517  iojap-like protein  47.62 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0831178  hitchhiker  0.0026713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0798  iojap-like protein  45.71 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.411993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0560  iojap-like protein  49.51 
 
 
143 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0440  iojap-like protein  42.16 
 
 
195 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  38.02 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  43.01 
 
 
108 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  45.74 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  44.09 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  40.4 
 
 
118 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  45.16 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  40.62 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  37.89 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  37.89 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  40.62 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  37.89 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  37.89 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  37.72 
 
 
166 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  42 
 
 
116 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  42 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  36.84 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  36.56 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  36.63 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  40.78 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  37.14 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  36.56 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  37.14 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  40.21 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  41.05 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  37.63 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  40.66 
 
 
191 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  41.49 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  38 
 
 
147 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  38 
 
 
149 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  37.74 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  37.76 
 
 
198 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  37.76 
 
 
198 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  38.78 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  39.13 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  37.89 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  40.21 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  37.63 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  37.37 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  33.02 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  34.74 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  38.54 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  34.74 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  34.74 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  34.74 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  40 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  38.54 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  39.36 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  36.56 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  38.3 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  41.05 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  37.63 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  38.46 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  36.45 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  35.78 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  39.58 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  39.58 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  31.2 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  41.84 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  35.35 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  35.87 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  40 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  35.05 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  35.51 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  35.79 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  38.3 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  34.69 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  34.95 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  35.58 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  32.63 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  39.81 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  32.54 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  35.77 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  37.11 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  35.63 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  33.33 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  32.99 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  38.78 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  37.11 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  35.24 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  39.13 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  36.26 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  32.67 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  32.61 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  34.78 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  35.11 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2562  iojap-like protein  39.64 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  35.24 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  30.77 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  33.67 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>